sahH异源表达揭示血链球菌生物膜形成不依赖autoinducer-2但与完整AMC相关

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE37007

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数据说明

在一项基于转录组的研究中，我们发现luxS的缺失对血链球菌SK36的细胞生长和代谢具有重大影响。生物膜缺陷型luxS缺失突变体通过来自铜绿假单胞菌的转基因sahH得到了互补。因此，与同基因野生型相比，luxS突变体中216个受影响基因中有209个的表达得以恢复（倍数变化n ≥ 3；p ≤ 0.05），包括参与细胞分裂过程、应激反应和分解代谢物控制的基因。在表型上，通过sahH的互补，血链球菌SR ΔluxS减少的生物膜厚度提升至野生型水平。无论是向血链球菌SR ΔluxS的培养物中添加生理浓度的人工自诱导物2（AI-2），还是在跨孔实验中存在野生型菌株，均未对luxS突变体的生物膜厚度产生累积效应。此外，我们在sahH互补的luxS突变体中鉴定出9个受AI-2直接调控的基因（倍数变化 ≥ 3；p ≤ 0.05），其中包括参与感受态发展的基因。

因此，我们得出结论：AI-2对生物膜生长没有影响，但在血链球菌感受态发育中具有调节功能。此外，我们发现了转基因sahH适用于互补中断的Pfs/LuxS通路，而不会恢复AI-2释放，从而获得了一个用于进一步研究AI-2的重要工具。目的：AI-2的存在对于血链球菌SK36的生物膜形成是否必要？luxS缺失的影响是什么？激活的甲硫氨酸循环被破坏是否是其失活导致生物膜深度受阻的原因？材料与方法：血链球菌SK36、血链球菌SR ΔluxS和血链球菌SR ΔluxS/sahH在CDM/蔗糖中厌氧培养24小时；通过番红和结晶紫染色测量生物膜深度。通过扫描电子显微镜研究生物膜形态。AI-2释放被监测

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。