氧化磷酸化突变体在病毒抗性中表现杂合子优势 [COX5A vs WT]
研究以果蝇为模型,比较 OXPHOS 基因 COX5A 杂合突变与野生型在病毒感染条件下的基因表达差异,旨在揭示杂合子优势的分子机制
![GSE349010: An Oxidative Phosphorylation Mutant Exhibits Heterozygote Advantage in Viral Resistance [COX5A vs WT]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/144998.jpg)
基本信息
资源简介
氧化磷酸化突变体在病毒抗性中表现杂合子优势 [COX5A vs WT]
An Oxidative Phosphorylation Mutant Exhibits Heterozygote Advantage in Viral Resistance [COX5A vs WT]
该数据集来自 NCBI GEO,标题为“An Oxidative Phosphorylation Mutant Exhibits Heterozygote Advantage in Viral Resistance [COX5A vs WT]”,包含 1 个文件 GSE349010_series_matrix.txt.gz,属于高通量测序表达谱数据。研究以果蝇为模型,比较 OXPHOS 基因 COX5A 杂合突变与野生型在病毒感染条件下的基因表达差异,旨在揭示杂合子优势的分子机制。数据可用于分析 COX5A 突变对病毒抗性的影响、筛选差异表达基因,以及探索翻译抑制与抗病毒防御的关系(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Sep 29 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):氧化磷酸化(OXPHOS)在大多数真核生物的能量产生中发挥基础性作用。尽管 OXPHOS 基因突变会导致严重的线粒体疾病,但这些突变在人群中 paradoxically 仍然普遍存在。我们假设这种悖论可以用杂合子优势来解释,即此类有害等位基因的杂合携带者在某些选择压力下获得适合度收益。在此,我们利用果蝇模型证明,OXPHOS 基因 COX5A 的杂合突变赋予了对病毒感染抗性的优势。我们进一步发现,这种优势源于整体蛋白质合成的减少,从而限制了病毒复制。扩展这一原理,我们表明核糖体蛋白基因 RpL14 和 RpS3 的杂合突变也增强了抗病毒抗性。因此,我们的研究将翻译受损确定为一种关键机制
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL25244、7227。本站分类:感染性疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE349010
【使用注意】
· 源站最后修改于 Oct 02 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
氧化磷酸化(OXPHOS)在大多数真核生物的能量产生中发挥着基础性作用。尽管OXPHOS基因突变会导致严重的线粒体疾病,但这些突变在人群中 paradoxically 仍然普遍存在。我们假设这一悖论可以通过杂合子优势来解释,即这类有害等位基因的杂合携带者在某些选择压力下获得适合度收益。在此,我们利用果蝇模型证明,OXPHOS基因COX5A的杂合突变赋予了对病毒感染抗性的优势。我们进一步发现,这一优势源于整体蛋白质合成的减少,从而限制了病毒复制。将这一原理加以延伸,我们发现核糖体蛋白基因RpL14和RpS3的杂合突变同样增强了抗病毒抗性。因此,我们的研究确定了翻译受损是OXPHOS突变在病毒感染期间赋予杂合子优势的关键机制基础,为线粒体疾病在人群中高频率出现提供了一个合理的进化解释。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




