氧化磷酸化突变体在病毒抵抗中表现杂合子优势 [Rotenone vs DMSO]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE349008

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

氧化磷酸化（OXPHOS）在大多数真核生物的能量产生中发挥着基础性作用。尽管OXPHOS基因突变会导致严重的线粒体疾病，但这些突变在人群中 paradoxically 仍然普遍存在。我们假设这一悖论可以通过杂合子优势来解释，即这类有害等位基因的杂合携带者在某些选择压力下获得适合度收益。在此，我们利用果蝇模型证明，OXPHOS基因COX5A的杂合突变赋予了对病毒感染抗性的优势。我们进一步发现，这一优势源于整体蛋白质合成的减少，从而限制了病毒复制。将这一原理加以延伸，我们发现核糖体蛋白基因RpL14和RpS3的杂合突变同样增强了抗病毒抗性。因此，我们的研究确定了翻译受损是OXPHOS突变在病毒感染期间赋予杂合子优势的关键机制基础，为线粒体疾病在人群中高频率出现提供了一个合理的进化解释。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。