VRC01单用或联合ART治疗早期急性HIV-1感染的1期随机对照试验转录组数据

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE348686

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

单次输注bNAb VRC01单独或联合ART治疗成人急性HIV-1感染的安全性与早期病毒学效应。来自RV398研究的24名参与者被随机分配接受：1）立即ART，2）VRC01联合立即ART，或3）VRC01联合7天后延迟ART。VRC01输注安全且耐受性良好，在血清、直肠黏膜、直肠和生殖道分泌物及脑脊液中均可检测到bNAb。分析使用各组第0、3、7和84天时间点收集的RNA-seq数据进行，区分转录组表达及高度相关的基因特征；结果突出显示，VRC01减少了外周炎症，尽管其对病毒血症和病毒储存库建立的影响极小，这与少数参与者携带中和敏感性HIV-1相一致。我们的发现强调了在测试bNAb的试验中进行转录组学分析的重要性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。