烟曲霉感染多形核白细胞胞外RNA(上清)

该数据集来自 NCBI GEO,聚焦烟曲霉感染人中性粒细胞后释放至上清组分的胞外 RNA,采用小 RNA 测序进行非编码 RNA 表达谱分析

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基因组GPL246769606
GSE348316: Aspergillus fumigauts-infected polymorphonuclear leukocyte extracellular RNA (supernatant)

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-25

资源简介

烟曲霉感染多形核白细胞胞外RNA(上清)

Aspergillus fumigauts-infected polymorphonuclear leukocyte extracellular RNA (supernatant)

该数据集来自 NCBI GEO,聚焦烟曲霉感染人中性粒细胞后释放至上清组分的胞外 RNA,采用小 RNA 测序进行非编码 RNA 表达谱分析。数据包含 1 个文件(GSE348316_series_matrix.txt.gz),可用于研究中性粒细胞胞外 miRNA 池的组成、抗微生物免疫调节功能及宿主与真菌互作中的胞外 RNA 作用(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Sep 22 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):胞外RNA(exRNAs)正逐渐被视为宿主-病原体互作中强有力的双向跨界效应分子,在植物和昆虫系统中尤为如此。本研究利用小RNA测序,提供了一个数据集,涵盖人中性粒细胞在响应人类真菌病原体烟曲霉(Aspergillus fumigatus)时释放至上清组分中的exRNA组。对胞外miRNA池的进一步观察显示,其中富集了具有抗微生物免疫调节作用的miR-223等。这些sRNA的分泌在很大程度上不受感染状态影响,提示中性粒细胞产生并维持一个针对烟曲霉的抗微生物exRNA环境,该环境需要进一步靶向研究。我们假设中性粒细胞产生的exRNA图谱有助于其在抗真菌防御中发挥多方面的作用。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24676、9606。本站分类:感染性疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE348316

【使用注意】

· 源站最后修改于 Oct 21 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

细胞外RNA(exRNAs)正逐渐成为宿主-病原体相互作用中强有力的双向跨界效应分子,尤其在植物和昆虫系统中。本研究利用小RNA测序技术,提供了人中性粒细胞在应对人类真菌病原体烟曲霉(Aspergillus fumigatus)时释放的上清液组分exRNA组数据集。对细胞外miRNA库的进一步分析显示,其中富集了具有抗菌免疫调节作用的miR-223等分子。这些小RNA的分泌在很大程度上不受感染状态的影响,提示中性粒细胞产生并维持着一个针对烟曲霉的抗菌exRNA环境,该环境需要进一步靶向研究。我们推测,中性粒细胞产生的exRNA图谱有助于其在抗真菌防御中发挥多方面的作用。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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