HDAC1调控慢性病毒感染中效应样CD8+ T细胞的CUT&RUN数据

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE297018

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

CD8+ T细胞耗竭是一个复杂的过程，涉及持续活化的CD8+ T细胞分化为功能各异的细胞亚群。在本研究中，我们探讨了关键表观遗传调控因子组蛋白去乙酰化酶1（HDAC1）在慢性病毒感染过程中耗竭性T（Tex）细胞分化中的作用。我们发现，HDAC1以CD8+ T细胞内在的方式调控效应样CX3CR1+ Tex细胞的生成与维持。HDAC1缺失导致以T细胞耗竭标志物高表达为特征的替代性Tex亚群扩增，并伴随病毒血症升高。在祖细胞Tex细胞中，HDAC1结合于效应样特征基因位点并促进其开放染色质状态，从而启动细胞命运向CX3CR1+ Tex亚群的特化。本研究揭示了HDAC1在CX3CR1+ Tex亚群分化中的选择性作用，该作用对于控制慢性感染期间的病毒载量至关重要。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。