GSE295522：Pexophagy驱动的氧化还原失衡促进病毒诱导的铁死亡

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE295522

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

过氧化物酶体是维持细胞氧化还原稳态的关键细胞器。许多病毒会诱导氧化应激并降解过氧化物酶体，但其机制和后果仍不清楚。在本研究中，我们系统研究了病毒诱导的过氧化物酶体自噬如何调控过氧化物酶体稳态。以新城疫病毒（NDV）为模型，我们证明NDV感染会触发过量的ROS产生，激活共济失调-毛细血管扩张突变（ATM）的磷酸化及其向过氧化物酶体的定位。活化的ATM促进过氧化物酶体受体PEX5与自噬受体p62之间的相互作用，从而驱动过氧化物酶体自噬。过氧化物酶体自噬介导的过氧化物酶体降解导致活性铁和ROS过度积累，促进NDV诱导的铁死亡。值得注意的是，该机制为其他病毒所共有，如水疱性口炎病毒（VSV）和H9N2禽流感病毒（IAV）。我们的研究为病毒诱导的过氧化物酶体自噬如何破坏氧化还原稳态以促进铁死亡提供了新见解，揭示了病毒感染、过氧化物酶体降解与程序性细胞死亡之间的新联系。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。