内源性逆转录病毒经RIG-I通路促进系统性红斑狼疮T细胞异常分化全转录组数据
该数据集来自NCBI GEO,包含系统性红斑狼疮患者CD4+ T细胞的全转录组重测序表达谱数据,共1个文件。研究通过全转录组重测序筛选并鉴定SLE患者CD4+ T细胞中过表达的HERVs,发现部分HERVs形成dsRNA诱导RIG-I信号通路激活,揭示HERVs与RIG-I在调控SLE患者T细胞异常
![GSE288271: Endogenous retroviruses promote aberrant T cell differentiation in systemic lupus erythematosus via the RIG-I pathway [whole transcriptomics]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/160357.jpg)
基本信息
资源简介
内源性逆转录病毒经RIG-I通路促进系统性红斑狼疮T细胞异常分化全转录组数据
Endogenous retroviruses promote aberrant T cell differentiation in systemic lupus erythematosus via the RIG-I pathway [whole transcriptomics]
该数据集来自NCBI GEO,包含系统性红斑狼疮患者CD4+ T细胞的全转录组重测序表达谱数据,共1个文件。研究通过全转录组重测序筛选并鉴定SLE患者CD4+ T细胞中过表达的HERVs,发现部分HERVs形成dsRNA诱导RIG-I信号通路激活,揭示HERVs与RIG-I在调控SLE患者T细胞异常分化中的作用与机制。数据可用于SLE相关基因表达分析及HERVs与RIG-I通路研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jan 28 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):T淋巴细胞的异常分化在系统性红斑狼疮(SLE)中起重要作用。然而,其潜在机制仍不清楚。在此,我们通过全转录组重测序筛选并鉴定了SLE患者CD4+ T细胞中许多过表达的HERVs,并发现一些HERVs形成dsRNAs以诱导RIG-I信号通路的激活。我们的发现揭示了HERVs和RIG-I在调控SLE患者T细胞异常分化中的作用和机制。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:感染性疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE288271
【使用注意】
· 源站最后修改于 Nov 18 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
T淋巴细胞的异常分化在系统性红斑狼疮(SLE)中发挥重要作用。然而,其潜在机制仍不清楚。在此,我们通过全转录组重测序筛选并鉴定了SLE患者CD4+ T细胞中许多过表达的人内源性逆转录病毒(HERVs),并发现部分HERVs形成双链RNA(dsRNAs)以诱导RIG-I信号通路的激活。我们的研究结果揭示了HERVs和RIG-I在调控SLE患者T细胞异常分化中的作用及机制。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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