GSE281836:RAP80 在单纯疱疹病毒 1 型生命周期中的多重作用

数据采用高通量测序进行基因组结合/占据谱分析,平台为 GPL24676,物种为 9606(人类)。可用于研究 RAP80 与病毒基因组的结合、对 HSV-1 转录的抑制机制,以及 ICP0/ICP4 与 RAP80 的相互作用(来源 NCBI)

geo
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基因组GPL246769606
GSE281836: Multifaceted roles of RAP80 during the Herpes simplex virus 1 life cycle

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-25

资源简介

GSE281836:RAP80 在单纯疱疹病毒 1 型生命周期中的多重作用

Multifaceted roles of RAP80 during the Herpes simplex virus 1 life cycle

该数据集来自 NCBI GEO,包含 1 个文件(GSE281836_series_matrix.txt.gz),主题为单纯疱疹病毒 1 型(HSV-1)生命周期中 DNA 损伤应答蛋白 RAP80 的多重作用。数据采用高通量测序进行基因组结合/占据谱分析,平台为 GPL24676,物种为 9606(人类)。可用于研究 RAP80 与病毒基因组的结合、对 HSV-1 转录的抑制机制,以及 ICP0/ICP4 与 RAP80 的相互作用(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Nov 13 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):单纯疱疹病毒 1 型(HSV-1)是一种广泛存在的人类病原体,可建立终身感染,但了解其在每个感染阶段的精确活动仍然具有挑战性。HSV-1 利用泛素化途径调节细胞因子以促进其复制周期,然而,阐明宿主蛋白降解后的级联反应及其对宿主-病毒平衡的后续影响仍然是一项复杂的工作。在这里,我们揭示了 DNA 损伤应答蛋白 RAP80 在 HSV-1 整个感染周期中的多重作用。在早期阶段,RAP80 通过直接结合病毒基因组来抑制 HSV-1 转录,阻断 ICP4(病毒蛋白)与转录因子的结合。这种相互作用通过 RAP80 与 ICP0/ICP4 之间复杂的相互作用以相分离方式受到调控。随着感染进展,病毒 E3 连接酶 ICP0 降解 RAP80,溶解

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24676、9606。本站分类:感染性疾病/其他。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE281836

【使用注意】

· 源站最后修改于 Nov 14 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

单纯疱疹病毒1型(HSV-1)是一种广泛存在的人类病原体,可建立终身感染,但了解其在每个感染阶段的确切活动仍具挑战性。HSV-1利用泛素化途径调节细胞因子以促进其复制周期,然而,阐明宿主蛋白降解后引发的级联反应及其对宿主-病毒平衡的后续影响仍是一项复杂的工作。在此,我们揭示了DNA损伤应答蛋白RAP80在HSV-1整个感染周期中的多方面作用。在感染早期,RAP80通过直接结合病毒基因组抑制HSV-1转录,阻断ICP4(病毒蛋白)与转录因子的结合。这种相互作用受RAP80与ICP0/ICP4之间复杂相互作用的相分离调控。随着感染进展,病毒E3连接酶ICP0降解RAP80,溶解相分离,并允许形成成熟的病毒复制区室。在感染晚期,RAP80被病毒去泛素化酶UL36USP去泛素化,从而恢复细胞稳态并促进HSV-1存活。

该过程涉及对R-loop-cGAS-凋亡通路的调控。这些发现凸显了病毒与宿主因子之间的动态相互作用,以及HSV-1颠覆宿主防御所采用的复杂机制,为未来抗病毒策略的开发提供了实际意义。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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