GSE275177：isavuconazole 处理 Candida auris 的分离株特异性转录组变化

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE275177

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数据说明

侵袭性真菌感染是全球范围内重要的医疗相关疾病，尤其在重症监护病房中更为突出。近年来，耳念珠菌（Candida auris）作为一种多重耐药且可能泛耐药的物种，已在全球范围内成为新的医院获得性病原体，六大洲至少50个国家已有报道。临床研究表明，先前明确界定的耳念珠菌系统发育分支在其致病性、毒力、代谢及对传统抗真菌治疗的敏感性方面存在显著差异。基于流行病学数据，属于南亚分支的分离株对氟康唑（97%）、两性霉素B（47%）的耐药比例最高，且该分支包含的多重耐药分离株数量最多（45%），这影响了所应用抗真菌治疗的疗效。过去十年中，一种新的广谱抗真菌药物艾沙康唑（isavuconazole，ISA）已进入临床实践。ISA主要获批用于治疗侵袭性曲霉病和毛霉病，目前尚无用于侵袭性念珠菌感染治疗的推荐意见。

在我们之前的研究中，我们报告了属于南亚谱系的不同分离株之间对ISA的敏感性概况存在差异。然而，全球转录反应——甚至是分离株特异性的——仍未得到解决。因此，我们的研究旨在利用高通量RNA测序（RNAseq）揭示与ISA暴露相关的那些分子事件。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。