SARS-CoV-2包膜蛋白或膜蛋白片段对HUVEC细胞基因表达的影响

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE268369

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

E蛋白的外侧片段在体外结合并调控人血管内皮细胞的基因表达。EC38片段位于SARS-CoV-2病毒包膜外的发现促使我们思考该片段是否会结合并影响宿主细胞的生物学特性。考虑到重症COVID-19期间存在病毒血症，我们更加关注循环系统。我们使用培养的人脐静脉内皮细胞（HUVECs）来检测EC38和MN19肽的结合情况以及结合后对基因表达的潜在影响。为验证目标肽与HUVEC的结合是否伴随细胞功能变化，我们用EC38和MN19肽（5μM）处理HUVEC 24小时，并通过RNA测序检测其转录组。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。