EBVaGC中EBV基因组三维结构调控病毒基因表达
该数据集来自NCBI,标题为EBVaGC中EBV基因组三维结构在调控病毒基因表达中的关键作用,属于感染性疾病分类。主题涉及高通量测序的基因组结合/占据谱分析,物种标签为9606

基本信息
资源简介
EBVaGC中EBV基因组三维结构调控病毒基因表达
GSE239995 是一个来自 NCBI 的数据集,标题为“The three-dimensional structure of the EBV genome plays a crucial role in regulating viral gene expression in EBVaGC”,即 EBVaGC 中 EBV 基因组三维结构在调控病毒基因表达中的关键作用。该数据集在本站归入感染性疾病 / 其他分类,主题涉及高通量测序的基因组结合/占据谱分析,物种标签为 9606,作者为 Italo、Tempera,发布时间为 Aug 03 202。数据集包含 1 个文件,样例文件为 GSE239995_series_matrix.txt.gz。以下依据可获得的信息对该数据集作分段介绍。
【数据集背景】
该数据集围绕 EBVaGC(EBV 相关胃癌)中 EBV 基因组三维结构对病毒基因表达的调控作用展开。源站标题直接点明了这一研究主题,即三维结构在调控病毒基因表达中扮演关键角色。数据集被归入感染性疾病 / 其他类别,主题标签指向“Genome binding/occupancy profiling by high throughput sequencing”,说明其数据属于通过高通量测序获得的基因组结合/占据谱分析类型。物种标签为 9606。源站描述指出,该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成,表明其组织方式为汇总多个子系列的上层数据集。
【数据内容】
数据集包含 1 个文件,样例文件名为 GSE239995_series_matrix.txt.gz,属于 GZIP 压缩格式。主题标签中列出了 GPL23185 与 9606,前者为平台编号,后者为物种标签。源站描述仅说明该 SuperSeries 由所列 SubSeries 构成,未进一步提供矩阵文件内的具体字段、样本数量或测量指标等信息。除上述文件与标签外,数据内容的具体构成源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov。作者为 Italo、Tempera,发布时间为 Aug 03 202。主题标签表明数据通过高通量测序产生,属于基因组结合/占据谱分析类型,涉及平台 GPL23185 与物种 9606。关于样本采集地点、时间跨度、实验处理细节等,源站未提供。
【适用场景】
根据主题标签,该数据集适用于高通量测序产生的基因组结合/占据谱分析相关的研究场景,可用于探讨 EBV 基因组三维结构与病毒基因表达调控之间的关系。由于归入感染性疾病 / 其他分类,也可作为感染性疾病领域相关分析的参考数据。具体适用的分析类型与方法,源站未提供。
【使用方法】
使用时可下载数据文件 GSE239995_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因格式或编码问题导致后续处理出错。关于矩阵文件的具体字段含义与解析方式,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集仅包含 1 个文件,源站描述较为简略,仅说明其为由 SubSeries 组成的 SuperSeries。样本量、数据完整性、质控指标等信息源站未提供。使用时应注意其作为汇总型数据集的性质,具体子系列内容需另行查阅。其他质量相关细节源站未提供。
【引用与许可】
作者为 Italo、Tempera,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于该数据集的引用方式与使用许可条款,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE239995
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.
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