NCBI GEO 来源的 GSE23750 原始数据层
差异表达分析用于评估溶组织内阿米巴感染后的基因差异。溶组织内阿米巴是全球范围内重要的腹泻病原体，并作为其疾病过程的一部分诱导肠道上皮细胞凋亡
基本信息
资源简介
NCBI GEO 来源的 GSE23750 原始数据层
GSE23750 Raw Data Layer from NCBI GEO 是一个聚焦感染性疾病领域的基因表达数据集，归属于“感染性疾病 / 其他”分类，数据经 synapse.org 平台获取。该数据集围绕溶组织内阿米巴（Entamoeba histolytica）感染后的宿主基因表达变化展开，采用差异表达分析来评估感染前后基因层面的差异。溶组织内阿米巴是全球范围内重要的腹泻病原体，其致病过程的一个重要环节是诱导肠道上皮细胞凋亡。该数据集所提供的原始数据层，为研究者观察感染引发的转录水平改变、探索病原体与肠道上皮相互作用机制提供了基础材料，适用于感染性疾病相关的基因表达研究与二次分析。
【数据集背景】
溶组织内阿米巴是一种在世界范围内具有重要公共卫生意义的腹泻病原体，其感染过程涉及对肠道上皮的损伤，诱导肠道上皮细胞凋亡被认为是其疾病过程的一部分。围绕这一病理过程，研究者关注感染发生后宿主基因表达谱发生了哪些改变，以及这些改变如何与上皮细胞凋亡等事件相关联。该数据集正是在这一研究背景下产生，通过差异表达分析的手段来评估溶组织内阿米巴感染后的基因差异，从而为理解感染致病的分子层面表现提供数据支撑。数据集被归入感染性疾病 / 其他类别，体现了其在感染性疾病研究中的定位。
【数据内容】
该数据集为原始数据层（Raw Data Layer），来源于 NCBI GEO，并经 synapse.org 平台提供获取。其核心内容与溶组织内阿米巴感染后的基因差异评估相关，即围绕感染条件下基因表达的变化组织数据。差异表达分析是该数据集所对应的主要分析视角，用于刻画感染前后基因层面的差异。关于数据的具体样本数量、分组构成、检测平台、基因数量、文件格式与体积等细节，源站未提供。
【采集与来源】
数据集英文名称为 GSE23750 Raw Data Layer from NCBI GEO，来源站为 synapse.org，其原始出处为 NCBI GEO。源站描述指出，差异表达被用于评估溶组织内阿米巴感染后的基因差异，并说明了溶组织内阿米巴作为全球重要腹泻病原体、在疾病过程中诱导肠道上皮细胞凋亡的背景信息。关于样本采集的具体时间、地点、人群特征、伦理审批信息以及实验操作的详细流程，源站未提供。
【适用场景】
基于其感染性疾病定位与差异表达分析主题，该数据集适用于溶组织内阿米巴感染相关的基因表达研究，例如考察感染后转录水平的变化、筛选与感染相关的差异表达基因、探讨肠道上皮细胞凋亡相关的基因表达特征，以及作为感染性疾病分子机制研究的辅助数据资源。此外，也可用于方法学层面的差异表达分析流程验证与教学演示等通用用途。关于该数据集在具体疾病分型、临床诊断或药物靶点研究中的适用性，源站未提供。
【使用方法】
该数据集以原始数据层的形式提供，使用者可依据差异表达分析的一般流程对数据进行处理，包括数据获取、预处理、表达差异计算与结果解读等环节。由于数据来自 NCBI GEO 并经 synapse.org 提供，使用时可结合这两个平台的相关说明进行下载与整理。关于具体的分析参数、推荐软件、标准化方法及配套元数据文件的使用方式，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为原始数据层，使用者在开展差异表达分析前通常需要自行完成相应的数据处理与质量控制。关于数据集的样本规模、数据完整性、批次效应、测序或芯片质量指标以及验证实验结果等信息，源站未提供。因此，在将本数据集用于结论性研究时，应结合源站描述与自身分析目的审慎评估其适用性。
【引用与许可】
该数据集来源于 NCBI GEO，并经 synapse.org 提供获取。关于数据的具体引用格式、作者信息、发表文献以及许可条款与使用限制，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
需登录公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://synapse.org/Synapse:syn234549
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
差异表达分析用于评估溶组织内阿米巴感染后的基因差异。溶组织内阿米巴是全球范围内重要的腹泻病原体，并通过诱导肠上皮细胞凋亡作为其致病过程的一部分。Regene
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络，提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
