PEDV易感与非易感细胞系转录组差异表达谱比较以鉴定PEDV进入相关关键分子

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE236338

标准获取流程：

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数据说明

猪流行性腹泻病毒（PEDV）是一种高度传染性的病毒，对全球养猪业构成严重威胁。尽管已开展了大量研究，但PEDV的功能性受体仍不明确。在本研究中，我们鉴定了对PEDV感染易感和不易感的细胞系，并对这些细胞系进行了RNA-seq分析。利用加权基因共表达网络分析（WGCNA），我们确定了与PEDV进入途径相关的关键通路。我们发现胆固醇、甾醇以及脂质转运与稳态与PEDV进入密切相关，提示胆固醇在PEDV进入中可能发挥作用。随后，我们用胆固醇转运抑制剂处理易感细胞系，发现抑制胆固醇转运可显著抑制这些细胞中PEDV的进入。综上所述，我们的结果表明胆固醇转运可能在PEDV进入易感细胞的过程中发挥关键作用，而靶向胆固醇转运可能成为控制PEDV传播的潜在策略。

我们的发现为PEDV进入机制提供了新的见解，并可能为开发针对这一具有重要经济意义的病毒的新治疗策略铺平道路。有必要进一步研究以阐明PEDV进入的详细机制，并探索胆固醇转运抑制剂作为控制PEDV传播手段的潜力。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。