中性粒细胞基因表达与COVID-19 ARDS患者28天呼吸机脱机关联数据集

该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,标题为中性粒细胞基因表达与COVID-19 ARDS患者28天呼吸机脱机的关联研究,属于感染性疾病/其他分类

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基因组预测GPL280389606COVID-19
GSE234904: Association of Neutrophil Gene Expression with 28-Day Ventilator Weaning in COVID-19 ARDS Patients

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-18

资源简介

中性粒细胞基因表达与COVID-19 ARDS患者28天呼吸机脱机关联数据集

GSE234904 是一项围绕中性粒细胞基因表达与临床结局关系展开的表达谱研究,其完整标题为“Association of Neutrophil Gene Expression with 28-Day Ventilator Weaning in COVID-19 ARDS Patients”,即探讨中性粒细胞基因表达与 COVID-19 相关急性呼吸窘迫综合征(ARDS)患者 28 天呼吸机脱机情况之间的关联。该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,在本站归入感染性疾病 / 其他分类,由作者 Daisuke、Motooka 提交,发布时间为 Jun 14 202。数据集以高通量测序进行表达谱分析,主题标签涉及 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL28038 与 9606,整体以 SuperSeries 形式组织,便于研究者从基因表达层面观察感染性疾病背景下免疫细胞转录特征与临床转归的联系。

【数据集背景】

该数据集聚焦于 COVID-19 相关 ARDS 患者的中性粒细胞基因表达,并将表达特征与 28 天呼吸机脱机这一临床结局相联系。中性粒细胞是感染与炎症反应中的重要效应细胞,其转录状态可能反映宿主免疫应答的差异。数据集标题明确指向“关联”研究,说明其设计目标在于考察基因表达与脱机结局之间的关系,而非单纯的表达谱描述。源站将其组织为 SuperSeries,由若干 SubSeries 组成,这种结构通常用于整合同一研究主题下的多个子系列数据,方便使用者按层次获取与理解数据。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件,文件样例为 GSE234904_series_matrix.txt.gz,即 GZIP 压缩格式的系列矩阵文件。该文件通常承载样本层面的表达矩阵及样本注释信息,是表达谱研究中常见的数据汇总形式。主题标签显示数据通过高通量测序产生,涉及平台 GPL28038 与物种编号 9606(人类)。源站描述仅说明该 SuperSeries 由下列 SubSeries 组成,未进一步展开各子系列的具体内容。除上述文件与标签信息外,样本数量、分组细节、基因数量等具体内容源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov,作者为 Daisuke、Motooka,发布时间为 Jun 14 202。源站描述表明其为 SuperSeries 结构,由所列 SubSeries 构成。关于样本采集地点、采集时间、受试者纳入排除标准、测序平台的具体型号与试剂等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于感染性疾病方向的表达谱研究场景,尤其是关注 COVID-19 ARDS 患者中性粒细胞转录特征与临床结局关联的分析。研究者可将其用于探索基因表达与 28 天呼吸机脱机之间的潜在联系,也可作为高通量测序表达谱数据用于方法学验证、候选基因筛选或与其他感染性疾病表达谱数据的对照分析。由于数据以系列矩阵形式提供,适合开展样本层面的表达比较与注释核对。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE234904_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认样本注释、表达值格式与编码方式无误后,再批量接入分析流程。由于该数据集为 SuperSeries,若需更细粒度的子系列数据,应结合源站所列 SubSeries 进一步获取;子系列的具体构成源站未提供。

【质量与限制】

该数据集文件数量为 1,内容以系列矩阵汇总为主,缺少原始测序读段等更底层数据的信息说明。样本量、分组规模、临床结局定义细节、批次信息与质控指标等均源站未提供,因此在未核对数据前不宜对统计效能与结论外推能力作出判断。此外,发布时间字段为“Jun 14 202”,年份信息不完整,引用时需以源站记录为准。

【引用与许可】

引用时应使用数据集英文名 GSE234904 及其完整标题,并注明来源站 ncbi.nlm.nih.gov 与作者 Daisuke、Motooka。关于该数据集的具体许可条款与使用限制,源站未提供,使用前应查阅源站页面确认。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE234904

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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