HIV特异性CD8+ Trm样细胞在扁桃体中表达耗竭特征（无自然HIV控制）[Seqwell]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE215125

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   • 天池: 登录后页面提供直链下载
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数据说明

淋巴组织是HIV的重要储存库部位，在抗逆转录病毒治疗和自然免疫的作用下仍持续存在。通过利用局部组织驻留记忆（TRM）CD8+ T细胞的抗病毒活性来靶向这些储存库备受关注，但关于HIV感染者（PLWH）淋巴结内TRM样细胞的数据有限。在此，我们研究了来自南非HIV感染者和未感染对照者的扁桃体CD8+ T细胞。我们发现这些细胞优先定位于生发中心（GCs）之外——生发中心是HIV的主要储存库部位——并表现出低细胞毒性和转录上TRM样的特征，与血液CD8+ T细胞不同。在HIV感染者中，CD8+ TRM样细胞高度扩增，并呈现更具细胞毒性、活化和耗竭的表型，且抗逆转录病毒治疗（ART）未能逆转该表型。与配对的血液相比，扁桃体中HIV特异性CD8+ T细胞的这种表型更为显著，提示扁桃体中抗原负荷更高。单细胞转录和克隆型分析显示，扁桃体中这些HIV特异性CD8+ T细胞在离体状态下表达异质性的T细胞活化、克隆扩增和耗竭特征。

有趣的是，这一特征在一位自然控制HIV感染者体内并未出现，该个体表达较低水平的PD-1和CXCR5，并且T细胞活化、耗竭及细胞溶解活性的转录证据减少。这些数据为HIV缓解状态下淋巴组织来源的HIV特异性CD8+ TRM样表型提供了重要见解，并强调了它们在免疫治疗和靶向HIV病毒库方面的潜力。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。