DNMT与HDAC抑制诱导人内源性逆转录病毒元件来源转录本产生免疫原性新抗原[RNA-Seq]
该数据集来自NCBI GEO，标题为DNMT与HDAC抑制诱导人内源性逆转录病毒元件来源转录本产生免疫原性新抗原[RNA-Seq]
![GSE209772: DNMT and HDAC inhibition induces immunogenic neoantigens from human endogenous retroviral element-derived transcripts [RNA-Seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/144793.jpg)
基本信息
资源简介
DNMT与HDAC抑制诱导人内源性逆转录病毒元件来源转录本产生免疫原性新抗原[RNA-Seq]
DNMT and HDAC inhibition induces immunogenic neoantigens from human endogenous retroviral element-derived transcripts [RNA-Seq]
该数据集来自NCBI GEO，标题为DNMT与HDAC抑制诱导人内源性逆转录病毒元件来源转录本产生免疫原性新抗原[RNA-Seq]。源站描述指出，研究旨在探究Decitabine与SB939处理对内源性逆转录病毒元件表达的影响。数据集包含1个文件，样例为GSE209772_series_matrix.txt.gz，作者为Christoph Plass，发布时间为Jul 26 202。主题标签涉及高通量测序表达谱分析、平台GPL30173及物种9606。该数据可用于分析药物处理下内源性逆转录病毒元件的表达变化，为免疫原性新抗原相关研究提供转录组层面的支持（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Jul 26 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：探讨地西他滨和SB939处理对内源性逆转录病毒元件表达的影响。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL30173、9606。本站分类：感染性疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE209772
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 10 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE209772
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
为研究地西他滨和SB939处理对内源性逆转录病毒元件表达的影响，我们用DMSO、地西他滨、SB939或地西他滨与SB939联合处理了9个细胞系，并进行了RNA-seq。该数据用于生成从头转录组组装，以识别由内源性逆转录病毒元件表达的新型mRNA。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
