小鼠脾脏pDC、pDC样细胞、tDC、cDC1与cDC2在稳态及病毒感染下的单细胞RNA测序比较

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE196720

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

浆细胞样树突状细胞（pDC）是病毒感染期间I型干扰素（IFN）的主要来源。由于缺乏能够在体内识别和靶向pDC而不影响pDC样细胞和过渡型DC（tDC）的工具，它们的其他功能存在争议，这些细胞具有重叠的表型和转录组，但T细胞激活效率更高。为克服这一瓶颈，我们设计、生成并验证了pDC-Tomato报告小鼠。我们将pDC-Tomato与Zbtb46 GFP小鼠杂交，获得了he ZeST小鼠品系，通过单细胞RNA测序，能够在稳态和鼠巨细胞病毒（MCMV）感染过程中对所有脾脏DC类型进行转录组分析。对转录组数据集的分析揭示了感染期间pDC样细胞与tDC的分歧激活。该数据集及相关的特异性基因模块将有助于阐明pDC与其他DC类型的生理功能。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。