枯草芽孢杆菌细胞包膜应激反应综合转录谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE160345

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

细菌细胞包膜是抵御环境威胁的第一道也是主要防线。由于其在细菌细胞生命中的关键作用，细胞包膜是众多抗生素的主要靶点。本研究通过用多种靶向细胞壁的抗生素处理革兰氏阳性模式菌株枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis），旨在利用高通量RNA测序方法开展转录组学研究，从而获得枯草芽孢杆菌细胞包膜应激反应的全局综合性转录谱。随后，将这些知识进行一系列比较基因组学分析，以获取枯草芽孢杆菌中细胞包膜应激感应调控系统的分布与保守性的详细信息。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。