多样病毒特异性naïve CD4 T细胞库的单细胞谱系图谱

该数据集来自NCBI GEO,标题为GSE158896,聚焦于多样病毒特异性naïve CD4 T细胞库的单细胞谱系图谱

geo
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基因组分类GPL1641710090
GSE158896: Single-cell lineage mapping of a diverse virus-specific naïve CD4 T cell repertoire

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-24

资源简介

多样病毒特异性naïve CD4 T细胞库的单细胞谱系图谱

Single-cell lineage mapping of a diverse virus-specific naïve CD4 T cell repertoire

该数据集来自NCBI GEO,标题为GSE158896,聚焦于多样病毒特异性naïve CD4 T细胞库的单细胞谱系图谱。源站描述指出,naïve多克隆CD4 T细胞库在急性病毒感染期间可分化为多个谱系,部分T细胞克隆表现出偏好的谱系选择,TCR α CDR3基序可部分影响克隆内在的向TFH命运的谱系偏好。数据集包含1个文件,样例为GSE158896_series_matrix.txt.gz,主题标签涉及高通量测序表达谱分析,物种为小鼠(10090),平台为GPL16417。该数据可用于研究病毒感染中CD4 T细胞谱系分化及克隆偏好机制(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Oct 01 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):naïve多克隆CD4 T细胞库在急性病毒感染期间可分化为多个谱系,部分T细胞克隆表现出偏好的谱系选择。TCR α CDR3基序可部分影响克隆内在的向TFH命运的谱系偏好。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL16417、10090。本站分类:感染性疾病/其他。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE158896

【使用注意】

· 源站最后修改于 Aug 27 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

The naïve polyclonal CD4 T cell repertoire can differentiate into multiple lineages during acute viral infection, with some T cell clones exhibiting a preferred lineage choice. TCR α CDR3 motifs can partially influence a clone-intrinsic lineage preference towards TFH fate.

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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