类战场应激背景下鼠疫耶尔森菌、登革病毒与葡萄球菌肠毒素B诱导的分子改变

该数据集为NCBI GEO上的SuperSeries,标题为类战场应激背景下鼠疫耶尔森菌、登革病毒与葡萄球菌肠毒素B诱导的分子改变

geo
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基因组分类Expression profiling by arrayGPL111549606
GSE117465: Molecular alterations induced by Yersinia pestis, dengue virus and Staphylococcus enterotoxin B under the background of battlefield-like stress

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-25

资源简介

类战场应激背景下鼠疫耶尔森菌、登革病毒与葡萄球菌肠毒素B诱导的分子改变

GSE117465 是 NCBI GEO 上的一个 SuperSeries,标题为“类战场应激背景下鼠疫耶尔森菌、登革病毒与葡萄球菌肠毒素B诱导的分子改变”。该数据集聚焦于在模拟战场应激的背景条件下,上述三种病原或毒素刺激所引发的分子层面变化,采用表达谱芯片技术进行检测,物种为人(9606),芯片平台为 GPL11154。数据集以 GZIP 压缩的 series matrix 文件形式提供,共 1 个文件,适合对感染性疾病相关表达谱数据感兴趣的研究者下载使用。以下依据可获得的信息对该数据集作进一步说明。

【数据集背景】

该数据集关注的是复合应激环境与病原刺激叠加条件下的宿主分子响应。鼠疫耶尔森菌、登革病毒与葡萄球菌肠毒素B分别代表细菌、病毒与细菌毒素三类不同的感染或刺激因素,而“类战场应激”则构成这些刺激发生的背景条件。数据集标题明确指向“诱导的分子改变”,说明其研究目的在于刻画上述因素作用下基因表达等分子层面的变化特征。本站将其归入感染性疾病 / 其他类别,与标题所体现的感染与免疫应答主题相符。

【数据内容】

数据集以 SuperSeries 形式组织,源站描述指出该 SuperSeries 由下方列出的若干 SubSeries 组成。实际交付的数据文件为 GSE117465_series_matrix.txt.gz,即 GZIP 压缩的系列矩阵文件,文件数量为 1。主题标签包含 Expression profiling by array、GPL11154 与 9606,表明数据来自芯片表达谱检测,平台编号为 GPL11154,物种为人。矩阵文件中通常包含样本层面的表达值及样本注释信息,具体字段构成需以文件实际内容为准。

【采集与来源】

数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov(NCBI GEO),作者为 seid,muhie,发布时间为 Jul 20 201(原文如此记录)。源站对该 SuperSeries 的描述仅为“由下方列出的 SubSeries 组成”,未提供更详细的实验设计、样本数量、处理条件或组织类型等信息。

【适用场景】

该数据集可用于感染性疾病相关的表达谱分析场景,例如比较不同病原或毒素刺激下的转录响应模式、考察应激背景对宿主分子改变的影响,以及作为芯片表达数据的整合分析素材。由于涉及人源样本与多种刺激因素,也可用于免疫应答与宿主-病原互作方向的探索性研究。

【使用方法】

使用时可先下载 GSE117465_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式解压读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入后续分析流程。

【质量与限制】

源站未提供样本量、生物学重复、质控指标与标准化方法等信息,SuperSeries 所包含的 SubSeries 明细亦未在现有信息中列出,因此数据质量与适用范围需使用者自行核查。发布时间记录为“Jul 20 201”,年份信息不完整。

【引用与许可】

源站未提供引用方式与许可条款,使用时请遵循 NCBI GEO 的相关政策并参考作者 seid,muhie 的原始发布信息。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE117465

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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