EXL01预防高危患者艰难梭菌感染复发评估

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT06306014

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病：艰难梭菌感染、复发性感染。艰难梭菌感染（CDI）是欧洲医院获得性腹泻的首要病因，每年超过12万例病例，近3700例死亡。该感染的特征是治愈后复发风险高，从首次发作后的近20%到2次复发后的超过60%，或在存在特定危险因素的情况下亦然。目前，CDI的一线治疗基于口服抗生素，如非达霉素或万古霉素。这些抗生素治疗对首次发作病例的有效率分别为89%和86%，但并不能纠正CDI发病所依据的微生物学失衡，反而可能因其所具有的抗菌谱而清除艰难梭菌以外的细菌，从而促使微生物群发生有害改变（菌群失调）得以持续，进而助长复发。在部分患者中，这种生态失衡在抗生素治疗后无法再恢复，导致CDI多次复发。

在此背景下，粪菌移植（FMT）用于预防多复发艰难梭菌感染（CDI）复发已被验证超过10年。FMT的原理是基于使用由健康供体粪便制成的药物制剂，以治疗为目的施用于患者消化道内。目前，对于多次复发的情况，它是推荐的一线治疗（自2次复发起）且最为有效，在治疗后8周内预防CDI复发的临床有效率为69%至89%，且具有良好的安全性特征。在促进CDI的微生物因素中，细菌物种Faecalibacterium prausnitzii的丢失构成了一个特定的治疗靶点。F. prausnitzii是人类肠道的共生细菌，占粪便微生物群的近5%，已被证明与个体的健康状态相关。其相对丰度的下降与……的增加相关

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。