结肠炎相关巨噬细胞调控NOD2依赖性细菌感知与肠道稳态

其主题围绕感染性疾病领域展开,聚焦于结肠炎相关巨噬细胞的异质性及其在 NOD2 依赖的细菌感知与肠道稳态维持中的作用。数据集由 Majid Ghassemian 提交,并通过 PRIDE 归档平台以 PXD066180 项目编号公开

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基因组感染性疾病其他NOD2Gut Homeostasis
Distinct Colitis-Associated Macrophages Drive NOD2-Dependent Bacterial Sensing and Gut Homeostasis

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

结肠炎相关巨噬细胞调控NOD2依赖性细菌感知与肠道稳态

该数据集英文名为 Distinct Colitis-Associated Macrophages Drive NOD2-Dependent Bacterial Sensing and Gut Homeostasis,来自 ebi.ac.uk,在本站归类为感染性疾病 / 其他。其主题围绕感染性疾病领域展开,聚焦于结肠炎相关巨噬细胞的异质性及其在 NOD2 依赖的细菌感知与肠道稳态维持中的作用。数据集由 Majid Ghassemian 提交,并通过 PRIDE 归档平台以 PXD066180 项目编号公开。作为一项公开可获取的感染性疾病相关数据集,它为研究者了解巨噬细胞在肠道炎症与细菌识别过程中的角色提供了数据基础,适合作为该方向研究的参考资源。

【数据集背景】

该数据集的研究主题涉及结肠炎相关巨噬细胞(Colitis-Associated Macrophages)的独特群体,以及这些细胞如何驱动 NOD2 依赖的细菌感知过程并参与肠道稳态的维持。NOD2 是参与细菌成分识别的重要受体,与肠道炎症和免疫稳态密切相关,因此该数据集所对应的研究背景处于感染性疾病与肠道免疫交叉的领域。数据集在本站被归入感染性疾病 / 其他分类,说明其内容与感染性疾病的公开数据资源体系相关联。源站将其作为 PRIDE 归档项目 PXD066180 对外发布,提交者为 Majid Ghassemian。

【数据内容】

源站未提供具体数据内容细节。已知该数据集的主题涵盖感染性疾病,其名称指向结肠炎相关巨噬细胞、NOD2 依赖性细菌感知与肠道稳态等研究方向。关于数据文件类型、样本数量、蛋白或基因鉴定数量、实验分组等具体内容,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,通过 PRIDE 归档平台公开,项目编号为 PXD066180,提交者为 Majid Ghassemian。源站描述将其标注为数据集(Dataset),并给出了对应的归档链接。关于样本采集方式、实验平台、仪器型号、采集时间与地点等信息,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题,该数据集可适用于感染性疾病领域的研究参考,尤其是涉及结肠炎相关巨噬细胞功能、NOD2 依赖的细菌感知机制以及肠道稳态维持等方向的分析工作。研究者可将其作为公开数据资源用于相关主题的探索与比较。关于具体的适用分析类型与方法学场景,源站未提供。

【使用方法】

源站未提供具体的使用方法说明。使用者可通过 ebi.ac.uk 上 PRIDE 归档的项目编号 PXD066180 访问该数据集。关于数据下载方式、文件格式解析、分析流程与软件工具等,源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量评估、质控指标、覆盖度或技术限制的说明。使用时应以源站归档页面所载信息为准。关于该数据集在样本规模、实验重复性等方面的具体限制,源站未提供。

【引用与许可】

引用信息可参考源站描述:Majid Ghassemian, Distinct Colitis-Associated Macrophages Drive NOD2-Dependent Bacterial Sensing and Gut Homeostasis [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD066180。关于该数据集的许可条款与使用限制,源站未提供。

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数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD066180

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  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Majid Ghassemian, Distinct Colitis-Associated Macrophages Drive NOD2-Dependent Bacterial Sensing and Gut Homeostasis [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD066180

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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