Orsay病毒感染与秀丽隐杆线虫扩散及食物选择研究数据集与R代码

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.23571024

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 120.8 KB。

数据说明

1. 四项独立的食物选择实验（BI、SC、AGR、PP）。将感染或未感染的动物置于与清洁食物或OrV污染食物相同距离处。在不同时间点计数向各食物源移动或随机移动的线虫数量。实验在ERT54野生型或eol-1突变体动物中进行。1.1. 数据集“Choice test 2 and 24 hpi.BI.xlsx”：对应实验者BI。在该实验中，非污染食物通过将细菌培养基与未感染动物的提取物混合制备，以控制OrV污染食物中可能存在的代谢物的影响。列“Strain”的值为“eol-1”和“ERT54”。ERT54为野生型秀丽隐杆线虫（C. elegans）。“eol-1”为参与嗅觉学习的eol-1基因的突变体。列“Treatment”的值为0 = 未感染对照，1 = OrV感染动物。列“Age”的值为L3 = 幼虫L3期，YA = 年轻成虫。列“Replicate”为标签，用于标识每个“Strain” × “Treatment” × “Age”组合的生物学重复（线虫培养板）。列“Choice”的值为-1 = 线虫偏好清洁食物，0 = 线虫无偏好，1 = 线虫偏好OrV污染食物。

“Time”列：暴露时间2小时和24小时。“Numworms”列：观察到的线虫数量。1.2. 数据集“Choice test 24 hpi.AGR y PP.xlsx”：对应实验人员AGR和PP，两人均在24小时后取样。该实验仅使用ERT54动物进行。未污染食物仅为细菌培养基。“Infected”列：值为0表示未感染对照，1表示感染OrV的动物。“Plaque”列：用于标识生物学重复（线虫培养板）的标签。“Behavior”列：值为-1表示线虫偏好清洁食物，0表示线虫无偏好，1表示线虫偏好受OrV污染的食物。“Numworms”列：观察到的线虫数量。“Block”列：1表示实验人员AGR，2表示实验人员PP。1.3. 数据集“Choice test 48 hpi.AGR.xlsx”：对应实验人员AGR，48小时后取样。该实验

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。