数据集:重叠感染与寄生虫毒力及宿主恢复的协同进化

该数据集来自 Dryad,对应 Kada 与 Lion 关于重叠感染如何影响宿主恢复与寄生虫毒力协同进化的研究。研究扩展了 van Baalen(1998)的协同进化模型以纳入重叠感染:当重叠感染易感性较低时,可重现原模型结果,存在无毒力寄生虫与防御较弱宿主、以及高毒力与高恢复两个潜在进化终点;当易

DryadDryad
dryad
浏览 20
基因组Multiple infectionsHost-parasite interactiontrade-offsCoevolution
Data from: Superinfection and the coevolution of parasite virulence and host recovery

基本信息

模态
基因组
大小
0.000803815 GB
许可
Creative Commons Zero v1.0 Universal
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

数据集:重叠感染与寄生虫毒力及宿主恢复的协同进化

Data from: Superinfection and the coevolution of parasite virulence and host recovery

该数据集来自 Dryad,对应 Kada 与 Lion 关于重叠感染如何影响宿主恢复与寄生虫毒力协同进化的研究。研究扩展了 van Baalen(1998)的协同进化模型以纳入重叠感染:当重叠感染易感性较低时,可重现原模型结果,存在无毒力寄生虫与防御较弱宿主、以及高毒力与高恢复两个潜在进化终点;当易感性超过阈值时,唯一可能的进化结果是高毒力与高防御投入。数据可用于研究多重感染、宿主-寄生虫互作与协同进化(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2015。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):寄生虫的宿主利用策略可能受到宿主防御策略和多重感染的影响。特别是,多种寄生虫株在宿主体内的竞争已被证明会选择更高的毒力。然而,关于多重感染如何影响宿主恢复与寄生虫毒力之间的协同进化,人们知之甚少。在此,我们扩展了 van Baalen(1998)提出的协同进化模型,以考虑重叠感染。当对重叠感染的易感性较低时,我们重现了 van Baalen 的结果,并表明存在两个可能的进化终点:一个具有无毒力寄生虫和防御较差的宿主,另一个具有高毒力和高恢复。然而,当对重叠感染的易感性超过阈值时,唯一可能的进化结果是高毒力和高防御投入。我们还表明 t

【主题与分类】

主题标签:Multiple infections、Host-parasite interaction、trade-offs、Coevolution。本站分类:感染性疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.8d6fg

使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。

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使用方式

数据集获取

源站:https://doi.org/10.5061/dryad.8d6fg

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 803.8 KB。

数据说明

寄生虫利用宿主的策略可能受到宿主防御策略和多重感染的影响。特别是,已有研究表明,多种寄生虫株在宿主体内的竞争会选择更高的毒力。然而,关于多重感染如何影响宿主恢复与寄生虫毒力之间的协同进化,目前知之甚少。在此,我们扩展了van Baalen(1998)提出的协同进化模型,以考虑超感染的情况。当对超感染的易感性较低时,我们重现了van Baalen的结果,并表明存在两个潜在的进化终点:一个是无毒力寄生虫和防御能力较弱的宿主,另一个是高毒力和高恢复力。然而,当对超感染的易感性超过某一阈值时,唯一可能的进化结果便是高毒力和高防御投入。我们还表明,宿主体内竞争可能导致选择较低的宿主恢复力,这是对更具毒力株系选择的结果。

我们探讨了不同寄生虫与宿主策略(如超级感染促进、竞争排斥)以及人口统计学和环境参数(如宿主繁殖力或各种防御成本)如何影响多重感染与宿主-寄生虫共同进化之间的相互作用。我们的模型显示,共同进化动态与多重感染之间的相互作用可能受到关键机制或生态细节的影响。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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