鼻窦微生物组采样技术比较数据集

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.cp8sr

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 212.3 MB。

数据说明

背景：鼻窦微生物组在CRS中的作用尚不明确。我们假设黏膜相关生物膜内的细菌可能与鼻窦中更表浅、自由漂浮的细菌不同，并且这可能影响所获得的微生物组结果。本研究探讨鼻窦黏膜组织样本与拭子样本的微生物群是否存在显著差异。方法：采用配对设计的横断面研究。从6例CRS患者的筛窦中术中获取黏膜活检和拭子样本。提取的DNA使用16S-rRNA基因靶向引物在Roche-454测序仪上进行测序。数据使用QIIME 1.8软件包进行分析。结果：在最大子采样深度为1，100条reads时，平均观察到的物种丰富度为33.3种（拭子为30.6种，黏膜为36种；p > 0.05）。两种采样方法在系统发育和非系统发育α多样性指标（Faith’s PD_Whole_Tree和Shannon指数）方面无显著差异（p > 0.05）。

样本类型对系统发育和非系统发育的β多样性指标（Unifrac和Bray-Curtis；p > 0.05）也无显著影响。结论：我们观察到黏膜组织与拭子样本的微生物群之间无显著差异。这表明，创伤较小的拭子样本能代表鼻窦黏膜微生物群，可用于未来的鼻窦微生物群研究。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。