数据:重建野生动物致死性传染病出现,支持人类运输传播的关键作用
该数据集来自公民科学项目,用于重建英国野生动物(两栖动物)中由 Ranavirus 属病原体引发的致死性传染病的出现过程

基本信息
资源简介
数据:重建野生动物致死性传染病出现,支持人类运输传播的关键作用
Data from: Reconstructing the emergence of a lethal infectious disease of wildlife supports a key role for spread through translocations by humans
该数据集来自公民科学项目,用于重建英国野生动物(两栖动物)中由 Ranavirus 属病原体引发的致死性传染病的出现过程。数据覆盖时空分布信息,可支撑对疾病报告增多、气候变化影响宿主与病原体互作、以及新型病原体空间传播三种假说的检验。分析揭示了与两栖动物扩散一致的邻近池塘局部传播,也发现了高度空间结构化的传播模式,可用于研究人类运输在疾病扩散中的作用(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。
【数据集背景】
源站首次发布:2016。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):尽管野生动物疾病出现对生物多样性和人类健康有广泛影响,但对其的重建研究很少。这在很大程度上归因于缺乏结构化和稳健的时空数据集。我们通过使用公民科学项目的数据并构建野生动物病原体(Ranavirus 属,感染两栖动物)传播的时空模型,克服了获取合适信息的后勤问题。我们评估了英国疾病报告快速增加的三个主要假说:疫情被更频繁地报告、气候变化改变了宿主与先前广泛分布的病原体之间的相互作用、以及疾病由于新型病原体的空间传播而出现。我们的分析刻画了与两栖动物扩散一致的邻近池塘局部传播,但也揭示了高度空
【主题与分类】
主题标签:emerging infectious disease、wildlife disease、anthropogenic drivers、translocation、ranavirus、Common frog、Rana temporaria。本站分类:感染性疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.27c8s
使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。
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源站:https://doi.org/10.5061/dryad.27c8s
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 455.4 KB。
数据说明
尽管野生动物疾病的出现对生物多样性和人类健康产生了广泛影响,但对其重建的研究却很少。这在很大程度上归因于缺乏结构化且稳健的时空数据集。我们通过利用一个公民科学项目的数据,并构建野生动物病原体(蛙病毒属,感染两栖动物)传播的时空模型,克服了获取合适信息的后勤难题。我们评估了关于英国疾病报告迅速增加的三个主要假设:疫情被更频繁地报告、气候变化改变了宿主与先前广泛存在的病原体之间的相互作用,以及疾病因新型病原体的空间传播而出现。我们的分析描述了从附近池塘开始的局部传播,这与两栖动物的扩散一致,但也揭示了在人类人口密度较高的地区,额外疫情爆发率显著升高的趋势——这表明人类活动也在传播该病毒。病原体基因组的系统发育分析支持至少两次独立传入英国的推断。
这些结果共同有力地表明,人类反复将蛙病毒从其他国家传入英国,并在英国境内的池塘之间传播,因此提示了潜在的控制措施。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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