基于PEP-TORCH肽组算法的分枝杆菌菌种与亚种精准鉴定数据集
主题标签：分枝杆菌、菌种鉴定、肽组学、PEP-TORCH算法、感染性疾病。本数据集为感染性疾病领域公开数据集，主题涵盖分枝杆菌。
基本信息
资源简介
基于PEP-TORCH肽组算法的分枝杆菌菌种与亚种精准鉴定数据集
该数据集英文名为 Data from: Precise Mycobacterial Species and Subspecies Identification Using the PEP-TORCH Peptidome Algorithm，属于感染性疾病领域的公开数据集，主题涵盖分枝杆菌。数据集来自 ebi.ac.uk，源站将其描述为 Duran Bao（2025）发布的“Precise Mycobacterial Species and Subspecies Identification Using the PEP-TORCH Peptidome Algorithm”数据集，项目编号为 PXD059923。围绕分枝杆菌、菌种鉴定、肽组学、PEP-TORCH 算法与感染性疾病等主题标签，该数据集面向分枝杆菌在种及亚种水平上的精准鉴定问题，为相关研究与分析工作提供公开可获取的数据资源。以下依据可获得的信息对该数据集作分段介绍。
【数据集背景】
分枝杆菌属包含多个菌种与亚种，准确鉴定到种及亚种水平对于感染性疾病的诊断、流行病学调查与相关研究具有重要意义。该数据集以“使用 PEP-TORCH 肽组学算法实现分枝杆菌种及亚种的精准鉴定”为主题，属于感染性疾病领域的公开数据集。其主题标签涵盖分枝杆菌、菌种鉴定、肽组学、PEP-TORCH 算法与感染性疾病，表明该数据集服务于以肽组学手段开展分枝杆菌鉴定这一研究方向。源站将其标注为感染性疾病分类下的数据集，说明其应用语境与感染性疾病的检测和识别相关。
【数据内容】
该数据集的主题涵盖分枝杆菌，并围绕菌种鉴定与肽组学展开，配套方法为 PEP-TORCH 肽组学算法。数据集名称明确指向“分枝杆菌种及亚种的精准鉴定”，因此其内容主题与分枝杆菌在种、亚种层面的鉴定相关。关于数据的具体组成、文件类型、样本数量、菌种覆盖范围、肽段或蛋白条目数量等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk，源站给出的描述为：Duran Bao（2025）. Precise Mycobacterial Species and Subspecies Identification Using the PEP-TORCH Peptidome Algorithm [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD059923。数据集发布于 2025 年，发布者为 Duran Bao，项目编号为 PXD059923。关于样本采集地点、采集时间、实验流程、仪器平台与试剂等信息，源站未提供。
【适用场景】
基于其主题标签与名称，该数据集适用于感染性疾病领域中以肽组学方式开展分枝杆菌鉴定的相关场景，包括分枝杆菌种及亚种水平的鉴定方法研究、PEP-TORCH 算法的应用与评估，以及围绕分枝杆菌鉴定开展的比较与分析工作。关于该数据集在其他具体应用场景中的适用性，源站未提供。
【使用方法】
该数据集通过 ebi.ac.uk 的 PRIDE 项目页面（项目编号 PXD059923）公开提供，使用者可依据源站页面获取数据。关于数据的下载方式、文件组织方式、预处理步骤、算法参数设置与结果复现流程等具体使用说明，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为公开数据集，发布年份为 2025 年，来源为 ebi.ac.uk。关于数据的完整性、准确性、样本规模、覆盖范围、批次效应及技术偏差等质量相关指标，源站未提供。使用者在引用或再利用时应以源站页面所载信息为准。
【引用与许可】
引用该数据集时，可参照源站给出的描述形式：Duran Bao (2025). Precise Mycobacterial Species and Subspecies Identification Using the PEP-TORCH Peptidome Algorithm [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD059923。关于该数据集的许可条款与使用限制，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD059923
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Duran Bao (2025). Precise Mycobacterial Species and Subspecies Identification Using the PEP-TORCH Peptidome Algorithm [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD059923
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
