Borrelia afzelii多重株感染：宿主内相互作用在抗原多样性维持中的作用数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.24k0s

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数据集大小约 110.0 KB。

数据说明

遗传多样性感染很常见，但关于共感染菌株在自然宿主-寄生虫系统中如何相互影响，我们知之甚少。为了探究野外环境中相互作用的本质及其后果，我们研究了由蜱传播的伯氏疏螺旋体（Borrelia afzelii）在其主要储存宿主之一——岸鼾（Myodes glareolus）中的情况。我们通过定量聚合酶链反应（PCR）测量了总体感染强度，并利用针对ospC基因（该基因编码一种免疫显性表面蛋白）的菌株特异性PCR检测方法，解析了多重感染的组成。我们发现了七种不同的菌株，依据ospC基因型定义。几乎没有证据表明存在影响感染强度的相互作用，但菌株高度聚集（即多重感染比随机共现预期的要多）。此外，两种OspC类型之间氨基酸水平的差异与其关联程度呈正相关。

总体而言，观察到的模式表明，在该系统中促进作用比竞争更为重要，且感染多样性更高的个体在建立和/或维持感染方面具有优势。我们提出，这种优势是促进抗原多样性的因素之一。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。