临床酿酒酵母菌株中已知突变等位基因不显著提高突变率的数据

该数据集来自 Dryad,对应 2017 年一项关于临床酿酒酵母菌株突变率的研究。研究关注 MLH1 与 PMS1 不兼容突变等位基因组合在自然临床分离株中的效应,检验经典进化理论中关于有性群体重组可阻止突变等位基因固定的预测

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基因组回归genetic backgroundmutatorsmutation rate
Data from: Known mutator alleles do not markedly increase mutation rate in clinical Saccharomyces cerevisiae strains

基本信息

模态
基因组
大小
0.086030072 GB
任务类型
回归
许可
Creative Commons Zero v1.0 Universal
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

临床酿酒酵母菌株中已知突变等位基因不显著提高突变率的数据

Data from: Known mutator alleles do not markedly increase mutation rate in clinical Saccharomyces cerevisiae strains

该数据集来自 Dryad,对应 2017 年一项关于临床酿酒酵母菌株突变率的研究。研究关注 MLH1 与 PMS1 不兼容突变等位基因组合在自然临床分离株中的效应,检验经典进化理论中关于有性群体重组可阻止突变等位基因固定的预测。数据覆盖遗传背景、突变等位基因与突变率等主题,可用于分析临床酵母菌株的突变率变化、突变等位基因组合的适合度影响,以及感染性疾病相关真菌的进化与耐药风险研究(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2017。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):自然选择有可能作用于所有表型,包括基因组突变率。经典进化理论预测,在无性群体中,导致高突变率的突变等位基因可因与有益突变的连锁而固定。这一现象已在实验中得到证明,并可能解释细菌病原体中发现的突变体频率。相比之下,在有性群体中,重组使突变等位基因与有益突变解耦,从而阻止突变体固定。在兼性有性的酵母 Saccharomyces cerevisiae 中,MLH1 和 PMS1 的分离等位基因已被证明不兼容,组合在一起时会导致高突变率。这些等位基因此前从未在自然界中一起被发现,但最近在一组临床分离株中被发现。在此,我们报告,这种不兼容的突变等位基因组合仅略微提高

【主题与分类】

主题标签:genetic background、mutators、mutation rate。本站分类:感染性疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.125p3

使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 86.0 MB。

数据说明

自然选择有可能作用于所有表型,包括基因组突变率。经典进化理论预测,在无性群体中,导致高突变率的增变等位基因可因与有益突变的连锁而固定。这一现象已通过实验得到证实,并可能解释在细菌病原体中发现的增变子频率。相比之下,在有性群体中,重组使增变等位基因与有益突变解耦,从而阻止增变子固定。在兼性有性酵母酿酒酵母中,MLH1和PMS1的分离等位基因已被证明不相容,组合在一起时会导致高突变率。这些等位基因从未在自然界中被发现同时存在,但最近在一组临床分离株中被发现。在此,我们报告,不相容的增变等位基因组合在这些临床菌株中仅略微提高突变率。基因组和系统发育分析未提供历史上突变率升高的证据。我们得出结论,增变等位基因的效应被背景遗传修饰因子所减弱。

因此,突变率与微生物致病性之间的关系可能比以往认为的更为复杂。我们的发现提供了罕见的观察证据,支持了进化理论中关于有性生物不太可能携带增加其基因组突变率的等位基因的观点。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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