人Borna病病毒1型脑炎病程中促炎生物标志物与组织免疫激活数据

数据涉及10例致死性BoDV-1脑炎患者的血清和脑脊液样本,用于分析不同细胞因子、趋化因子、生长因子及其他生物标志物随时间的变化;其中1例还分析了尸检福尔马林固定脑组织的炎症标志物mRNA水平和免疫染色,另1例仅分析固定脑组织

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2023-06-01 更新
浏览 6
表格预测BoDV-1bornavirusmicrogliaastrocytecytokinechemokine
Data from: Human Borna disease virus 1 encephalitis shows marked pro-inflammatory biomarker and tissue immunoactivation during the course of disease

基本信息

模态
表格
大小
0.000035986 GB
任务类型
预测
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-06-01
版本
v2

资源简介

人Borna病病毒1型脑炎病程中促炎生物标志物与组织免疫激活数据

Human Borna disease virus 1 encephalitis shows marked pro-inflammatory biomarker and tissue immunoactivation during the course of disease

该数据集来自tandf.figshare.com,配套2022年发表于Emerging Microbes & Infections的研究,包含2个Excel附录表格。数据涉及10例致死性BoDV-1脑炎患者的血清和脑脊液样本,用于分析不同细胞因子、趋化因子、生长因子及其他生物标志物随时间的变化;其中1例还分析了尸检福尔马林固定脑组织的炎症标志物mRNA水平和免疫染色,另1例仅分析固定脑组织。数据可用于研究人BoDV-1脑炎病程中的免疫激活特征(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Human Borna disease virus 1 encephalitis shows marked pro-inflammatory biomarker and tissue immunoactivation during the course of disease》发表于 Emerging Microbes & Infections(2022),DOI:10.1080/22221751.2022.2098831。项目资助方:This work was supported by Bundesministerium für Bildung und Forschung [grant number 01KI2005C]; Joachim Herz Stiftung [grant number 34901609]; Bornavirus Focal Point Bavaria [grant number 01KI2002].。源站首次发布:2022-07-27。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):人Borna病病毒1型(BoDV-1)脑炎是一种致死率极高的严重新发疾病。尽管临床疾病、病例定义、诊断算法和神经病理学已有描述,但人们对人BoDV-1脑炎的免疫学过程知之甚少。在此,我们分析了10例致死性BoDV-1脑炎患者的血清和脑脊液(CSF)样本中不同细胞因子、趋化因子、生长因子及其他生物标志物随时间的变化。其中1例个体还分析了尸检福尔马林固定脑组织,通过mRNA水平和免疫染色检测炎症生物标志物的表达;另1例患者仅可获得福尔马林固定脑组织并额外进行了检查。结果显示,从急性BoDV-1脑炎初期到末期,存在显著且不断增强的免疫激活。

【数据结构与技术规格】

文件数 2 个,合计 35.99 KB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.20229311.v2。

【主题与分类】

源站学科分类:Biochemistry、Medicine、Cell Biology、Neuroscience、Chemical Sciences not elsewhere classified、Immunology。主题标签:BoDV-1、bornavirus、microglia、astrocyte、cytokine、chemokine。本站分类:感染性疾病/其他。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Biochemistry、Medicine、Cell Biology、Neuroscience、Chemical Sciences not elsewhere classified、Immunology。

【获取与许可】

源站页面:https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Human_Borna_disease_virus_1_encephalitis_shows_marked_pro-inflammatory_biomarker_and_tissue_immunoactivation_during_the_course_of_disease/20229311

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Human Borna disease virus 1 encephalitis shows marked pro-inflammatory biomarker and tissue immunoactivation during the course of disease. Taylor & Francis. Rauch, Jessica; Steffen, Johanna Friederike; Muntau, Birgit; Gisbrecht, Jana; Pörtner, Kirsten; Herden, Christiane; et al

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-01,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "Online Appendix Table 1.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/36444172"
curl -L -o "Online Appendix Table 2.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/36444175"

文件清单

  • Online Appendix Table 1.xlsx(11.03 KB)
  • Online Appendix Table 2.xlsx(24.95 KB)

文件总体积 35.99 KB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

人类博尔纳病病毒1型(BoDV-1)脑炎是一种严重的新发疾病,病死率极高。尽管其临床疾病表现、病例定义、诊断流程及神经病理学已有描述,但人们对人BoDV-1脑炎的免疫学过程知之甚少。本研究分析了10例致死性BoDV-1脑炎患者的血清和脑脊液(CSF)样本,以观察不同细胞因子、趋化因子、生长因子及其他生物标志物随时间的变化。其中1例患者还对其尸检福尔马林固定脑组织进行了分析,通过mRNA水平和免疫染色检测炎症生物标志物的表达;另1例患者仅可获得福尔马林固定脑组织,亦一并进行了检测。结果显示,在急性BoDV-1脑炎从初期到末期的过程中,血清和脑脊液中存在显著且不断增强的免疫激活,其特征为细胞因子浓度变化(IFNγ、IL-5、IL-6、IL-9、IL-10、IL-12p40、IL-13、IL-18、TGF-β1),且随时间推移以促炎模式为主。

在内皮细胞、星形胶质细胞和小胶质细胞中证实了IFNγ的产生,在活化的小胶质细胞中证实了IL-6的产生,在内皮细胞、活化的星形胶质细胞和小胶质细胞中证实了TGF-β1的产生。与此平行的是趋化因子(CCL-2、CCL-5、CXCL-10、IL-8)的增加,以吸引免疫细胞至感染部位,促进炎症和组织损伤。观察到病理性的低生长因子水平(BDNF、β-NGF、PDGF)。精氨酸酶和sTREM水平的改变进一步促进了促炎状态。这种失衡的促炎状态可能在人类BoDV-1脑炎的致命结局中起重要贡献,并可能是潜在治疗尝试的关键靶点。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.20229311.v2(source: https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Human_Borna_disease_virus_1_encephalitis_shows_marked_pro-inflammatory_biomarker_and_tissue_immunoactivation_during_the_course_of_disease/20229311)。

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