青光眼患者视网膜小胶质细胞单细胞测序数据集
该数据集来源于 doi.org,包含青光眼患者与健康对照者视网膜小胶质细胞的单细胞 RNA 测序表达矩阵,共涉及三名青光眼患者和三名健康对照

基本信息
资源简介
青光眼患者视网膜小胶质细胞单细胞测序数据集
该数据集名为 Single-Cell Sequencing of Retinal Microglia in Glaucoma Patients,聚焦眼及附器疾病中的青光眼方向,来源于 doi.org,由 Huihui Chen 与 Gong 完成,机构信息标注为 Science Data Bank,发布时间为 2026 年。数据集的核心内容是青光眼患者与健康对照者视网膜小胶质细胞的单细胞 RNA 测序表达矩阵,共涉及三名青光眼患者和三名健康对照。源站描述指出,青光眼是导致不可逆性失明的最常见原因,该研究旨在探究青光眼患者视网膜中小胶质细胞的表型与功能变化,并在青光眼视网膜中鉴定出一类疾病相关小胶质细胞(DAM)。数据集主题标签涵盖临床医学、青光眼、小胶质细胞与视网膜,整体属于临床医学与单细胞组学交叉的数据资源。
【数据集背景】
青光眼是导致不可逆性失明的最常见原因,其病理机制涉及视网膜内多种细胞类型的变化。小胶质细胞作为视网膜中的固有免疫细胞,其表型与功能改变在青光眼发病过程中受到关注。为系统研究这一问题,相关研究采用单细胞 RNA 测序技术,对青光眼患者视网膜小胶质细胞的转录组特征进行刻画,并与健康对照进行比较,以期揭示疾病状态下小胶质细胞的变化规律。该数据集正是在这一研究背景下产生,服务于青光眼视网膜小胶质细胞病理机制的探索。
【数据内容】
数据集包含青光眼患者与健康对照者视网膜小胶质细胞的单细胞 RNA 测序表达矩阵,样本规模为三名青光眼患者和三名健康对照。源站描述说明,在当前研究中仅提取并分析了三名青光眼患者的数据,并据此在青光眼视网膜中鉴定出一类疾病相关小胶质细胞(DAM)。数据内容以表达矩阵形式组织,属于单细胞转录组层面的数据资源,主题上归属于临床医学,并带有青光眼、小胶质细胞、视网膜等标签。
【采集与来源】
数据来源于 doi.org,机构信息标注为 Science Data Bank,作者为 Huihui Chen 与 Gong,发布时间为 2026 年。样本来源为青光眼患者与健康对照者的视网膜小胶质细胞,采集与测序的具体流程、样本纳入标准、伦理审批信息等在源站描述中未提供。
【适用场景】
该数据集适用于青光眼相关的基础与临床转化研究,尤其是围绕视网膜小胶质细胞表型与功能变化的分析工作。研究者可基于单细胞 RNA 测序表达矩阵,探讨青光眼状态下小胶质细胞的转录组异质性,验证或拓展疾病相关小胶质细胞(DAM)的鉴定结果,也可将其作为青光眼视网膜免疫微环境研究的参考数据。此外,数据可服务于临床医学领域中关于青光眼发病机制的教学与方法学演示。具体分析场景的适用范围源站未提供。
【使用方法】
数据集以单细胞 RNA 测序表达矩阵的形式提供,使用者可按照单细胞转录组数据的常规分析流程进行读取、质控、降维聚类与细胞类型注释等处理。由于源站描述说明当前研究仅提取并分析了三名青光眼患者的数据,使用者在复现或扩展分析时应注意样本构成。数据下载方式、文件格式、矩阵维度与配套元数据等细节,源站未提供。
【质量与限制】
数据集涉及三名青光眼患者与三名健康对照,样本量较小,源站描述中未提供测序深度、细胞数量、质控指标等质量参数。当前研究仅提取并分析了三名青光眼患者的数据,对照数据虽包含在数据集中但未在该研究中分析,使用者在解读结果时需考虑这一限制。其他质量控制信息与局限性说明,源站未提供。
【引用与许可】
数据集的作者为 Huihui Chen 与 Gong,机构信息标注为 Science Data Bank,来源站为 doi.org,发布时间为 2026 年。引用格式、许可协议与使用条款等具体信息,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://doi.org/10.57760/sciencedb.35495
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
青光眼是不可逆性失明最常见的病因。为探究青光眼患者视网膜中小胶质细胞的表型与功能变化,本数据集包含来自3例青光眼患者和3例健康对照者的视网膜小胶质细胞单细胞RNA测序表达矩阵。在本研究中,仅提取并分析了3例青光眼患者的数据。我们在青光眼视网膜中鉴定出一种疾病相关小胶质细胞(DAM)。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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