Kashi_RDG1(KRDG1)新型Cluster K1分枝杆菌噬菌体基因组特征与感染动力学数据

该数据集来自 zenodo.org,围绕新分离的分枝杆菌噬菌体 Kashi_RDG1(KRDG1)的基因组特征与感染动力学研究,包含 13 个文件,涉及电镜图像、吸附曲线、pH 与生长曲线、一步生长曲线等实验数据

Banaras Hindu UniversityBanaras Hindu University
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2025-08-27 更新
浏览 8
基因组分枝杆菌噬菌体KRDG1Cluster K1感染动力学基因组分析噬菌体治疗结核病
Data from: Genomic profile and infection dynamics of Kashi_RDG1 (KRDG1), a novel Cluster K1 mycobacteriophage infecting mycobacterial hosts

基本信息

模态
基因组
大小
0.021568079 GB
许可
cc-by-4.0
创建/更新时间
2025-08-27

资源简介

Kashi_RDG1(KRDG1)新型Cluster K1分枝杆菌噬菌体基因组特征与感染动力学数据

Genomic profile and infection dynamics of Kashi_RDG1 (KRDG1), a novel Cluster K1 mycobacteriophage infecting mycobacterial hosts

该数据集来自 zenodo.org,围绕新分离的分枝杆菌噬菌体 Kashi_RDG1(KRDG1)的基因组特征与感染动力学研究,包含 13 个文件,涉及电镜图像、吸附曲线、pH 与生长曲线、一步生长曲线等实验数据。数据可用于噬菌体生物学特性分析、感染动力学研究,并为结核病及耐药分枝杆菌的噬菌体治疗探索提供基础资料(来源 Zenodo,cc-by-4.0 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2025-08-26。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):结核病(TB)由结核分枝杆菌引起,仍是全球传染病死亡的主要原因之一,耐多药(MDR)菌株发病率上升构成重大公共卫生挑战。2023年,TB 影响超过 1080 万人,并在全球造成约 125 万人死亡,凸显了有效干预的紧迫性。传统抗生素在此类情况下往往不足,促使人们需要新的抗菌策略。噬菌体疗法已成为一种有前景的替代方案,具有物种特异性活性以及在细菌宿主内选择性自我扩增的能力。本研究报道了使用耻垢分枝杆菌 mc²155 分离的分枝杆菌噬菌体 Kashi_RDG1(KRDG1)的分离和详细表征。基因组分析将 KRDG1 鉴定为 Cluster K1 的成员,一个

【数据结构与技术规格】

文件数 13 个,合计 21.57 MB。数据集 DOI:10.5281/zenodo.16946808。

【主题与分类】

主题标签:分枝杆菌噬菌体、KRDG1、Cluster K1、感染动力学、基因组分析、噬菌体治疗、结核病。本站分类:感染性疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/records/16946808

使用许可:cc-by-4.0。

【使用注意】

· 源站最后修改于 2025-08-27,引用时请注意版本时效。

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数据集获取(Zenodo 公开直链)

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文件清单

  • flm.tif(1.6 MB)
  • KRDG1 TEMP.pzf(0.2 MB)
  • GROWTH CURVE LAG PHASE.pzf(0.2 MB)
  • Adsorption curve file final.pzf(0.1 MB)
  • KRDG1 pH.pzf(0.2 MB)
  • Growth curve log phase.pzf(0.3 MB)
  • Ppt Characterization zenodo.pptx(16.9 MB)
  • One step growth curve.tif(0.0 MB)
  • Host range.csv(0.0 MB)
  • circular map.png(0.2 MB)
  • sequence clustering.tif(0.3 MB)
  • MOI FILE.pzf(0.2 MB)
  • comparative genomics.tif(0.4 MB)

数据集大小约 21.6 MB。

数据说明

结核病(TB)由结核分枝杆菌引起,仍是全球传染病死亡的主要原因之一,耐多药(MDR)菌株发病率不断上升,构成重大公共卫生挑战。2023年,全球结核病患病人数超过1080万,导致约125万人死亡,凸显了有效干预措施的紧迫性。在此类病例中,传统抗生素往往效果不佳,促使人们需要新型抗菌策略。噬菌体疗法已成为一种有前景的替代方案,具有种特异性活性以及在细菌宿主体内选择性自我扩增的能力。本研究报道了分枝杆菌噬菌体Kashi_RDG1(KRDG1)的分离及详细表征,该噬菌体使用耻垢分枝杆菌mc²155分离获得。基因组分析鉴定KRDG1属于Cluster K1,该组已被证明能有效靶向致病性分枝杆菌菌种。KRDG1基因组大小为58,681 bp,含有95个预测开放阅读框(ORF),其中39个具有功能注释。

透射电子显微镜分析证实其具有Siphoviridae形态,而宿主范围分析显示其对偶然分枝杆菌(机会性病原体)和结核分枝杆菌H37Ra(一种减毒Mtb菌株)以及耻垢分枝杆菌具有多价活性。一步生长曲线揭示其潜伏期为80分钟,爆发量为100噬菌体/细菌细胞,支持其高效的感染动力学。值得注意的是,生长动力学表明其对数期宿主细菌具有强烈的杀灭作用。虽然KRDG1表现出温和特性,但其与先前工程化治疗性噬菌体(ZoeJ)的密切基因组相似性凸显了其可能进行遗传修饰的潜力。因此,KRDG1可作为未来开发针对致病性分枝杆菌和非分枝杆菌感染的噬菌体疗法的潜在候选者。

许可

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