防御性共生中抗生素保护进化稳定性数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.6907h

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 4.44 GB。

数据说明

人类病原体耐药性的不断增强严重限制了抗生素在医学中的疗效，然而包括独居蜂狼在内的许多动物，数百万年来一直成功地与产抗生素细菌建立防御联盟。在此，我们报道了25个蜂狼宿主物种和亚种的共生体原位产生49种衍生物，分属三类抗生素化合物（45种杀粉蝶菌素衍生物、3种链氯菌素衍生物和尼日利亚菌素），跨越6800万年的进化历程。尽管抗生素混合物在定性上高度稳定，但我们发现物种间以及不同地理区域之间存在一致的定量差异，这可能反映了对当地病原体群落的适应。对三种主要成分进行的抗菌生物测定，以及基于杀粉蝶菌素生物合成基因簇中聚酮合酶结构域的结构和特异性的计算机预测，为在自然环境中产生复杂抗微生物化合物混合物的机制基础和生态进化意义提供了见解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。