蝙蝠、灵长类与哺乳动物gammaherpesvirus演化起源及多样化数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.sg0k6

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 165.3 MB。

数据说明

γ疱疹病毒(γHVs)通常被认为具有宿主特异性，并在数百万年间与其宿主共同分化。这一信条在此受到挑战，通过迄今最大规模的哺乳动物γHVs样本对两个病毒基因进行广泛系统发育分析，首次整合了来自公共数据库的蝙蝠γHV序列以及从两种吸血蝙蝠物种(Desmodus rotundus和Diphylla ecaudata)新生成的病毒序列。蝙蝠和灵长类病毒频繁出现在支持的系统发育树深层分支中，并与来自远缘哺乳动物类群的病毒聚集在一起。经过进化情景测试，我们确定了宿主转换和共物种形成的次数。跨物种传播的发生频率远高于先前估计，且大多数传播可归因于蝙蝠和灵长类。

我们得出结论，γ疱疹病毒亚科的进化受到了跨物种传播及随后在特定病毒谱系内共物种形成的双重驱动，并且在整个进化历程中，蝙蝠和灵长类目可能作为超级传播者，对其他哺乳动物类群产生了影响。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。