脊椎动物鹅型溶菌酶基因家族演化数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.681sn

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 114.0 KB。

数据说明

背景：鹅型溶菌酶是一种抗菌酶，最初在一些鸟类的蛋中发现，但最近在包括非脊椎动物在内的其他物种中也有发现。一些先前鉴定的鹅型溶菌酶序列被认为具有改变的分泌潜力和酶活性，然而这些改变序列的分布尚不清楚。在某些物种中存在鹅型溶菌酶基因的重复拷贝；然而，这些重复拷贝的起源及其在功能改变中的作用尚不明确。结果：我们从118种脊椎动物中鉴定出234个鹅型溶菌酶序列，其中包括181个全长或接近全长的序列，代表了除软骨鱼外的所有脊椎动物纲。系统发育分析表明，大多数鹅型溶菌酶基因重复是近期或谱系特异性事件，但有三次扩增事件更为古老，分别发生在早期羊膜动物、早期哺乳动物和早期真骨鱼类中。较古老的基因重复与功能变化相关，包括分泌潜力和胞壁酸酶抗菌酶活性的改变。结论：鹅型溶菌酶是一种必需的胞壁酸酶，广泛存在于脊椎动物中。

溶菌酶g基因的重复，以及失去酶活性的非分泌型同工酶的保留，表明溶菌酶g除了作为抗菌酶相关的溶菌酶活性外，还具有其他活性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。