数据集：2012年尼泊尔三地区霍乱暴发揭示多重耐药O1群霍乱弧菌克隆传播

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.600nd

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 792.2 KB。

数据说明

背景：尽管地方性霍乱每年在尼泊尔导致显著的发病率和死亡率，但有关致病菌信息的缺乏往往阻碍了霍乱的干预和预防。2012年，腹泻疫情影响了尼泊尔三个地区，并有确诊病例死亡。本研究旨在了解与2012年尼泊尔霍乱疫情相关的霍乱弧菌的耐药模式、来源及传播情况。方法：对2012年腹泻疫情中分离出的霍乱弧菌（n = 28）{n = 22；加德满都（n = 12）、多蒂（n = 9）、巴江（n = 1）}以及地表水（n = 6；加德满都）进行了抗菌反应测试。通过聚合酶链反应、DNA测序和脉冲场凝胶电泳（PFGE）进行多位点基因筛查，以确定菌株的毒力特性和DNA指纹图谱。结果：从患者和地表水中分离出的所有霍乱弧菌菌株均被证实为产毒株，属于O1血清群、小川血清型、El Tor生物型，并具有古典生物型霍乱毒素（CTX）。双错配扩增突变分析（DMAMA）-PCR显示，霍乱弧菌

霍乱弧菌菌株携带ctx亚单位B的B-7等位基因。tcpA的DNA测序显示在第64位氨基酸发生点突变（N[右箭头]S），而ctxAB启动子则显示有四个串联七聚体重复序列5[上标]-TTTTGAT-3[上标]的拷贝。霍乱弧菌拥有弧菌第七次大流行岛（VSP）-I的所有开放阅读框，但缺乏VSP-II的ORFs 498-511。所有菌株均表现出多重耐药性，对甲氧苄啶-磺胺甲噁唑（SXT）、萘啶酸（NA）和链霉素（S）耐药；所有菌株均携带SXT遗传元件。对NAR菌株（n = 4）的gyrA和parC进行DNA测序及推导氨基酸序列分析，分别揭示了第83位（S[右箭头]I）和第85位（S[右箭头]L）氨基酸的点突变。相似的PFGE（NotI）图谱显示尼泊尔霍乱弧菌

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。