基本信息

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创建/更新时间

2026-10-23

资源简介

37例确诊细菌性脑膜炎婴儿首次与第二次采样的CSF参数

该数据集英文名为 “CSF parameters in the first and second sampling of 37 infants with proven bacterial meningitis.”，来自 ebi.ac.uk，主题涵盖细菌性脑膜炎、脑脊液、蛋白质组、婴儿、感染性疾病与宿主反应，属于感染性疾病领域的公开数据集。数据集围绕确诊细菌性脑膜炎的婴儿展开，涉及第一次与第二次采样所获得的脑脊液参数，可用于观察同一批婴儿在不同采样时点的脑脊液特征。其来源站描述指向 Anahita Bakochi（2021）关于脑脊液蛋白质组图谱检测脑膜炎病原特异性宿主反应模式的研究数据集。整体而言，该数据集以婴儿细菌性脑膜炎为对象，以脑脊液为样本类型，兼具蛋白质组与宿主反应的研究主题，适合作为感染性疾病领域相关分析的基础资源。

【数据集背景】

该数据集所属主题为细菌性脑膜炎，聚焦于确诊细菌性脑膜炎的婴儿群体。细菌性脑膜炎是感染性疾病领域的重要议题，而脑脊液检查是相关临床与研究工作中的常见样本来源。数据集名称明确指向“第一次与第二次采样”的脑脊液参数，说明其设计上关注同一批婴儿的重复采样信息。来源站描述进一步表明，相关研究关注脑脊液蛋白质组图谱在检测脑膜炎病原特异性宿主反应模式方面的作用。由此，该数据集处于感染性疾病、脑脊液蛋白质组学与婴儿宿主反应研究的交叉位置，主题标签包括细菌性脑膜炎、脑脊液、蛋白质组、婴儿、感染性疾病与宿主反应。

【数据内容】

数据集英文名称表明其内容为 37 名确诊细菌性脑膜炎婴儿第一次和第二次采样中的脑脊液参数。主题标签涵盖细菌性脑膜炎、脑脊液、蛋白质组、婴儿、感染性疾病与宿主反应。来源站描述提及“脑脊液蛋白质组图谱”以及“病原特异性宿主反应模式”，说明该数据集与脑脊液蛋白质组层面的宿主反应研究相关。关于具体参数项目、检测指标种类、两次采样之间的时间间隔、样本量细节与数据文件结构，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk。源站描述为 Anahita Bakochi（2021）的 “Cerebrospinal fluid proteome maps detect pathogen-specific host response patterns in meningitis” 数据集，并给出链接 https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD024904。数据集对象为确诊细菌性脑膜炎的婴儿，样本类型为脑脊液，采样设计包括第一次与第二次采样。关于采样机构、采样流程、伦理审批与样本处理细节，源站未提供。

【适用场景】

基于其主题与对象，该数据集可用于感染性疾病领域中以婴儿细菌性脑膜炎为背景的研究场景，尤其是围绕脑脊液参数与蛋白质组宿主反应模式的分析。由于名称明确区分第一次与第二次采样，适合用于关注同一批婴儿重复采样特征的研究。主题标签中的“蛋白质组”与“宿主反应”提示其可用于病原特异性宿主反应相关探讨。关于具体适用的分析模型、临床决策场景与验证用途，源站未提供。

【使用方法】

数据集通过 ebi.ac.uk 提供，源站描述中给出了项目链接 https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD024904，可据此访问该数据集。关于数据下载方式、文件格式、字段说明、预处理步骤与使用协议，源站未提供。

【质量与限制】

数据集名称明确样本为 37 名确诊细菌性脑膜炎婴儿，并包含第一次与第二次采样，样本规模与重复采样设计已在名称中体现。关于数据完整性、缺失情况、质量控制指标、批次效应与偏倚评估，源站未提供。由于对象限定为确诊细菌性脑膜炎婴儿，其适用范围应结合该人群特征理解；其他人群或非细菌性脑膜炎情形下的外推需谨慎。关于限制的更多具体信息，源站未提供。

【引用与许可】

引用信息可依据源站描述：Anahita Bakochi (2021). Cerebrospinal fluid proteome maps detect pathogen-specific host response patterns in meningitis [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD024904。关于该数据集的许可条款与使用限制，源站未提供。

原始链接

https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD024904

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD024904

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Anahita Bakochi (2021). Cerebrospinal fluid proteome maps detect pathogen-specific host response patterns in meningitis [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD024904

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别