自贡市第四人民医院感染重症监护数据库

来自中国四川自贡市第四人民医院重症监护单元的常规采集数据,涵盖2019年1月至2020年12月期间收治的患者。新版本更新了体温缺失信息

physionet
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其他预测感染性疾病重症监护电子病历PhysioNet回顾性数据
Critical care database comprising patients with infection at Zigong Fourth People's Hospital

基本信息

模态
其他
任务类型
预测
许可
PhysioNet Credentialed Health Data License 1.5.0
创建/更新时间
2026-10-06
版本
1.1

资源简介

自贡市第四人民医院感染重症监护数据库

该数据集为一份聚焦感染性疾病重症监护场景的临床数据库,收录自中国四川省自贡市第四人民医院重症监护单元收治的感染患者。数据来源于日常诊疗过程中常规采集的信息,覆盖2019年1月至2020年12月期间的住院患者。数据集在PhysioNet平台以“icu-infection-zigong-fourth”为标识发布,本站将其归入感染性疾病/其他类别。根据源站说明,新版本对体温缺失信息进行了更新。该数据集适用于重症感染相关研究,但使用需遵循PhysioNet Credentialed Health Data License 1.5.0的许可条款。

【数据集背景】

该数据集由位于中国四川省的自贡市第四人民医院的重症监护单元产生,针对的是感染性疾病患者群体。其时间跨度为2019年1月至2020年12月,属于回顾性常规采集数据。源站标题为“icu-infection-zigong-fourth”,英文全称为“Critical care database comprising patients with infection at Zigong Fourth People's Hospital”。数据集在PhysioNet上发布,本站分类为感染性疾病/其他。该数据集的出现,为感染性疾病重症监护领域的真实世界研究提供了来自中国地方医院的数据资源。

【数据内容】

数据集涵盖的是自贡市第四人民医院重症监护单元中感染患者的常规采集数据。具体变量种类、字段数量、样本量、患者人口学分布、感染类型、病情严重程度评分、实验室指标、治疗措施、结局信息等详细内容,源站未提供。已知的是,数据中涉及体温信息,且新版本更新了体温缺失信息。除体温相关更新外,其他数据元素的完整性与缺失情况,源站未提供。

【采集与来源】

数据采集自中国四川省自贡市第四人民医院的重症监护单元,采集对象为2019年1月至2020年12月期间收治的感染患者。采集方式为常规临床诊疗过程中的记录,属于真实世界数据。数据来源站为physionet.org。关于采集的具体流程、伦理审批信息、数据脱敏方法、数据字典或变量说明等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于感染性疾病重症监护相关的观察性研究、真实世界证据生成、临床预测模型开发与验证、流行病学描述等场景。由于数据来自中国地方医院的重症监护单元,可能适用于探索区域性感染患者特征、重症监护资源利用、体温等生理指标的动态变化等研究方向。但具体适用场景需结合数据实际变量与质量判断,源站未提供详细的适用建议或研究案例。

【使用方法】

数据集通过PhysioNet平台发布,使用需遵循PhysioNet Credentialed Health Data License 1.5.0。该许可通常要求用户完成 credentialed 认证,并遵守数据使用协议。关于数据的具体下载方式、文件格式、访问权限申请流程、是否需要签署数据使用协议、是否允许商业使用、是否允许再分发等细节,源站未提供。用户应直接访问PhysioNet上该数据集的页面获取最新使用说明。

【质量与限制】

该数据集为常规采集数据,可能存在缺失值、记录不一致等问题。源站特别指出,新版本更新了体温缺失信息,说明体温字段在旧版本中存在缺失情况。除此之外,数据质量的其他方面,如缺失率、异常值、重复记录、数据完整性、标注准确性等,源站未提供。该数据集仅覆盖单一医院、特定时间段内的感染患者,外推性可能受限。关于样本量、患者纳入排除标准、数据清洗方法等,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的许可为PhysioNet Credentialed Health Data License 1.5.0。使用该数据集时,应按照PhysioNet的要求进行引用和致谢。具体的引用格式、致谢要求、许可条款全文、数据使用限制等,源站未提供。用户应查阅PhysioNet上该数据集的官方页面,获取准确的引用信息和许可细节。

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取(PhysioNet)

PhysioNet 数据需注册账号(机构邮箱)并签署数据使用协议后下载:

  1. 在 https://physionet.org/content/icu-infection-zigong-fourth/1.1 页面登录并接受许可条款;
  2. 命令行整目录下载:
wget -r -N -c -np --user=<账号> --ask-password https://physionet.org/files/icu-infection-zigong-fourth/1.1/
  1. 或用官方工具(推荐,支持断点续传与校验):
pip install physionet-download
physionet-download icu-infection-zigong-fourth

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

在重症监护室(ICU)接受治疗的患者会受到密切监测并接受强化治疗。这种积极的监测和治疗会从电子健康记录和护理记录中生成高粒度数据。这些数据不仅为日常临床实践提供了基础设施,还能为临床研究提供信息。整合和清理来自多种来源的医疗数据在技术上具有挑战性。尽管西方国家有几个开放获取的重症监护数据库,但缺乏针对中国成年患者的此类数据库。我们建立了一个涉及感染患者的重症监护数据库。这些患者中很大一部分患有脓毒症和/或脓毒性休克。包括实验室检查结果、基线特征、用药情况、ICD编码、护理记录和随访结果在内的高粒度数据被整合起来,形成了一个综合数据库。该数据库可用于多种临床研究。

许可

PhysioNet Credentialed Health Data License 1.5.0

引用

学术使用请引用:PhysioNet. Critical care database comprising patients with infection at Zigong Fourth People's Hospital. DOI 10.13026/xpt9-z726。

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