波兰、德国和比利时中华绒螯蟹中保守的Hepatospora eriocheir序列：比较分子研究

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.23540987

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 4.8 MB。

数据说明

该数据集支持题为《来自波兰、德国和比利时的中华绒螯蟹中保守的肝孢子虫序列：一项比较分子研究》的手稿。该数据集包含来自在波兰（n = 24）、德国（n = 18）和比利时（n = 15）采集的57只中华绒螯蟹（Eriocheir sinensis）的标本关联分子数据，其中包括2020年采集的波兰标本和2022年采样的额外标本。通过SSU rRNA测序确认了26只螃蟹感染了肝孢子虫（Hepatospora eriocheir）。该数据集包括宿主线粒体细胞色素c氧化酶亚基I（COI）序列、寄生虫小亚基核糖体RNA（SSU rRNA）和精氨酰-tRNA合成酶（ArgRS）序列、同源比对、GenBank登录号交叉引用、标本级元数据、补充表格和可重复分析脚本。26条寄生虫SSU rRNA序列在共享的794个位置的比对中完全相同，26条ArgRS序列在624个核苷酸片段中完全相同。该数据集还包括原始的MEGA最大似然系统发育分析文件、Newick树和分析参数。

补充表S1提供了各标本的标识符、采样信息、感染状态及序列登录链接。补充表S2包含参考序列信息和核苷酸变异数据。图1记录了所选蟹的宏观外观：BE3（阳性）、BE15（阴性）、DE4（阳性）和DE1（阴性）。该数据集旨在促进独立验证、比较分子研究以及未来对中华绒螯蟹欧洲种群中H. eriocheir的分布和遗传多样性的调查。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。