常规卫生服务实验室与研究实验室对年幼儿童尿路感染微生物学诊断的比较：诊断队列研究

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• 源站标题：Comparison of microbiological diagnosis of urinary tract infection in young children by routine health service laboratories and a research laboratory: Diagnostic cohort study
• DOI：10.1371/journal.pone.0171113
• 发布日期：2017-02-15
• 文件数：8 个
• 文件总体积：1.79 MB
• 源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Comparison_of_microbiological_diagnosis_of_urinary_tract_infection_in_young_children_by_routine_health_service_laboratories_and_a_research_laboratory_Diagnostic_cohort_study/4655125

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文件清单

• S1 Fig.pdf（302.50 KB）
• S2 Fig.pdf（177.85 KB）
• S1 Table.pdf（272.00 KB）
• S2 Table.pdf（256.92 KB）
• S3 Table.pdf（191.23 KB）
• S4 Table.pdf（192.41 KB）
• S5 Table.pdf（205.00 KB）
• S1 Text.pdf（187.16 KB）

文件总体积 1.79 MB（源站 API 实测）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

目的
比较常规卫生服务实验室与研究实验室处理的尿液样本之间，通过尿培养诊断尿路感染（UTI）的有效性。人群与方法
我们在4808名年龄5 CFU/mL的尿路病原体（参考标准）的急性病患儿中开展了一项前瞻性诊断队列研究，由常规卫生服务实验室和中心研究实验室通过尿液样本培养进行诊断。我们分别根据样本是通过清洁接取还是尿布（纸尿裤）垫获取，计算了由预先设定的症状、体征和试纸检测结果（“指标试验”）预测UTI的受试者工作特征曲线下面积（AUC）。结果
卫生服务实验室和研究实验室分别将251名（5.2%）和88名（1.8%）儿童分类为UTI阳性。实验室之间的一致性为中等（kappa = 0.36；95%置信区间[CI] 0.29, 0.43），清洁接取样本（0.54；0.45, 0.63）优于尿布垫样本（0.20；0.12, 0.28）。

在清洁中段尿样本中，卫生服务实验室的AUC较低（AUC=0.75；95%CI 0.69，0.80），而研究实验室为0.86（0.79，0.92）。尿布垫样本的AUC值（卫生服务实验室和研究实验室阳性分别为0.65[0.61，0.70]和0.79[0.70，0.88]）低于清洁中段尿样本。结论
比较常规卫生服务实验室与研究实验室对UTI的微生物学诊断一致性，清洁中段尿样本为中等，尿布垫样本为差，且尿布垫样本的可靠性低于清洁中段尿样本。研究实验室的阳性结果似乎比常规卫生服务实验室的阳性结果更可能反映真实的UTI，后者中许多（尤其是来自尿布垫样本者）可能由污染所致。卫生服务实验室应考虑对儿科尿液样本采用研究实验室所用的程序。基层医疗临床医生应尽量获取清洁中段尿样本，即使在非常年幼的儿童中也是如此。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0171113（source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/Comparison_of_microbiological_diagnosis_of_urinary_tract_infection_in_young_children_by_routine_health_service_laboratories_and_a_research_laboratory_Diagnostic_cohort_study/4655125）。