BLUE CORAL:PETAL COVID-19 观察性研究的生物学与纵向流行病学
数据访问说明:请参阅下方“授权访问”部分,了解从该登录号访问数据与许多其他 dbGaP 登录号有何不同。生物样本:生物样本的获取通过 NHLBI 生物样本与数据存储库信息协调中心(BioLINCC)进行
基本信息
资源简介
BLUE CORAL:PETAL COVID-19 观察性研究的生物学与纵向流行病学
BLUE CORAL(Biology and Longitudinal Epidemiology of PETAL COVID-19 Observational Study)是一项针对 COVID-19 相关住院患者开展的观察性研究数据集,英文全称为 Biology and Longitudinal Epidemiology of PETAL COVID-19 Observational Study。该数据集在分类上归属于感染性疾病 / 其他,来源站为 doi.org,作者为 Thompson, Boyd,所属机构为 NHLBI BioData Catalyst,发布时间为 2024 年。该数据集的核心目标在于测量 COVID-19 相关住院之后症状、失能状况与财务状况的发生率及其随时间的变化,并配套提供生物样本资源。需要特别说明的是,该数据集的访问方式与 dbGaP 上许多其他登录号存在差异,相关说明指向“授权访问”部分;生物样本的获取则通过 NHLBI 生物样本与数据存储库信息协调中心(BioLINCC)进行。
【数据集背景】
对于许多个体而言,COVID-19 的影响在急性期之后仍持续存在。该数据集所依托的研究即以此为背景,聚焦于 COVID-19 相关住院之后的中长期健康与经济后果。研究设定为观察性研究(Observational Study),并带有纵向(Longitudinal)特征,同时结合生物学(Biology)与流行病学(Epidemiology)两个维度,构成 PETAL COVID-19 观察性研究的一部分。其目标明确为测量 COVID-19 相关住院后症状、失能(disability)与财务状况(financial status)的发生率以及随时间的变化情况。
【数据内容】
该数据集配套的生物样本种类较为丰富,涵盖支气管灌洗液(Bronchial Lavage)、血浆(Plasma)、气管吸出物(Tracheal Aspirate)、尿液(Urine)、全血血沉棕黄层(Whole Blood Buffy Coat)、DNA、血清(Serum)等;其中血浆、血清、尿液与全血在来源描述中被重复列出。需要留意的是,生物样本的使用在非遗传研究与遗传研究两个层面上均采用分级(tiered)方式管理。关于数据集内具体变量、随访时间点、样本量等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 doi.org,作者为 Thompson, Boyd,所属机构为 NHLBI BioData Catalyst,发布年份为 2024 年。生物样本的获取渠道为 NHLBI 生物样本与数据存储库信息协调中心(BioLINCC),并提供了对应的研究页面链接。关于样本采集的具体流程、采集地点与时间安排,源站未提供。
【适用场景】
基于其研究目标,该数据集适用于考察 COVID-19 住院后症状、失能与财务状况的发生率及时间变化的分析场景;其配套生物样本可用于非遗传与遗传两个层面的研究,但须遵循分级使用的要求。关于更具体的适用研究设计或分析类型,源站未提供。
【使用方法】
数据访问方面,源站明确提示:该登录号的数据访问方式与许多其他 dbGaP 登录号不同,需参阅“授权访问”部分了解详情。生物样本方面,须通过 NHLBI 生物样本与数据存储库信息协调中心(BioLINCC)申请获取,且使用按非遗传与遗传研究分级管理。关于具体的申请步骤、审批流程与使用条件,源站未提供。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量、样本代表性、缺失情况或偏倚控制等方面的具体信息。已知的限制性信息主要包括两点:其一,数据访问方式区别于多数 dbGaP 登录号,需按“授权访问”要求处理;其二,生物样本使用在非遗传与遗传研究上均实行分级管理。
【引用与许可】
该数据集的作者为 Thompson, Boyd,所属机构为 NHLBI BioData Catalyst,发布年份为 2024 年,来源站为 doi.org。关于具体的引用格式、许可条款与使用协议,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://doi.org/10.60645/bdc-59o9-nlun
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
数据访问说明:关于本登录号数据访问方式与许多其他dbGaP登录号有何不同的信息,请参阅下文“授权访问”部分。生物样本:生物样本的获取通过NHLBI生物样本与数据存储库信息协调中心(BioLINCC)进行。PETAL BLUE CORAL的生物样本包括:支气管灌洗液、血浆、气管吸出物、尿液、全血白膜层、DNA、血浆、血清、尿液和全血。请注意,生物样本的使用在非遗传学研究和遗传学研究方面均设有层级。目标:测量COVID-19相关住院后症状、残疾和财务状况的发生率及其随时间的变化。背景:对许多人而言,COVID-19的影响在急性期后持续存在,并导致长期症状和残疾。这促使人们广泛开展工作,以描述此类COVID-19后遗症的流行病学特征。
然而,准确数据有限,阻碍了为患者、照护者和政策制定者提供咨询建议,以及规划以康复为重点的相关临床研究的能力。因此,BLUE CORAL研究旨在填补知识空白,并提供关键数据以帮助指导临床诊疗、公共卫生和科学工作。参与者:共纳入1376名COVID-19患者,其中825人(444名男性,379名女性)至少完成了一次随访调查。BLUE CORAL成年参与者中的一个子集被纳入扩展研究FIRE CORAL。FIRE CORAL是一项多中心前瞻性队列研究,研究对象为出院后从COVID-19疾病中康复的参与者。设计:BLUE CORAL是一项前瞻性队列研究。参与者的入组时间为2020年8月24日至2021年7月20日,随访持续至3月30日
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络,提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




