疑似感染急诊成人血RNA测序队列（病毒、细菌、COVID19及健康对照）
该数据集来自英国牛津的队列研究，对2014年9月至2020年6月期间因疑似感染就诊于急诊、后续确诊为病毒感染、细菌感染、COVID19的成人患者及健康对照进行全血RNA测序
基本信息
资源简介
疑似感染急诊成人血RNA测序队列（病毒、细菌、COVID19及健康对照）
Blood RNA sequencing was performed on a cohort of adults attending the Emergency Department with suspected infection who had subsequently-confirmed viral, bacterial, COVID19 and healthy controls
该数据集来自英国牛津的队列研究，对2014年9月至2020年6月期间因疑似感染就诊于急诊、后续确诊为病毒感染、细菌感染、COVID19的成人患者及健康对照进行全血RNA测序。样本采集于招募时，使用Tempus Blood RNA管保存并提取总RNA，经核糖体和珠蛋白RNA去除后，在Illumina HiSeq 4000平台上进行双端150bp、约3000万 reads的测序。数据可用于感染性疾病转录组特征发现与分类研究（来源 BioStudies）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：该队列由2014年9月至2020年6月期间招募的患者组成。它包括在急性入院背景下患有菌血症和病毒诊断检测阳性的患者。所有确诊感染的患者均用于特征发现。在招募时使用Tempus Blood RNA管采集全血，并按照制造商说明使用Tempus Spin RNA Isolation Kit（ThermoFisher Scientific）分离总RNA。RNA样本在进一步分析前储存于−80 °C。经过额外的DNAse处理后，使用Illumina的TruSeq® RNA Sample Preparation Kit进行文库制备和3000万条150bp双端reads的测序；使用Illumina Ribo-Zero Gold试剂盒去除核糖体和珠蛋白RNA，并在英国牛津的The Wellcome Centre for Human Genetics的HiSeq 4000上进行测序。
【主题与分类】
主题标签：RNA-seq of coding RNA、Homo sapiens。本站分类：感染性疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面：https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-MTAB-13307
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
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- OpenDataLab:
数据说明
Myrsini Kaforou；Shiranee Sriskandan（2024）。对一组因疑似感染就诊于急诊科、随后确诊为病毒感染、细菌感染、COVID-19的成年人及健康对照者进行了血液RNA测序[数据集]。https://www.ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-MTAB-13307
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
