BASIC：基于单细胞RNA-seq的B细胞受体组装
该数据集来自ebi.ac.uk，属于感染性疾病/其他分类，主题标签为单细胞编码RNA的RNA-seq与Homo sapiens
基本信息
资源简介
BASIC：基于单细胞RNA-seq的B细胞受体组装
BASIC: B-cell receptor (BCR) assembly from single cell RNA-seq
该数据集来自ebi.ac.uk，属于感染性疾病/其他分类，主题标签为单细胞编码RNA的RNA-seq与Homo sapiens。源站描述介绍了一个名为BASIC的软件工具，用于从单细胞RNA测序数据中组装B细胞受体的全长重链和轻链序列。为验证工具效用，研究者对来自人类供体的单个B细胞进行scRNA-seq，组装全长重链和轻链，并通过单细胞引物巢式PCR和Sanger测序进行实验确认。该数据可用于单细胞水平B细胞受体序列组装方法的研究与验证（来源 BioStudies）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：B细胞受体（BCR）使单个B细胞能够识别多种抗原，包括细菌和病毒蛋白。尽管RNA-seq的进展使得单细胞中转录表达的高通量分析成为可能，但从B细胞单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中组装全长重链和轻链序列这一独特任务在很大程度上尚未被研究。我们开发了一个新的软件工具BASIC，允许研究人员利用scRNA-seq在单细胞水平组装BCR序列。为证明我们软件的效用，我们对来自人类供体的单个B细胞进行了scRNA-seq，组装了全长重链和轻链，并通过使用基于单细胞引物的巢式PCR和Sanger测序对这些结果进行了实验确认。
【主题与分类】
主题标签：RNA-seq of coding RNA from single cells、Homo sapiens。本站分类：感染性疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面：https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-MTAB-4745
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数据说明
E-MTAB-4745 BASIC：来自单细胞RNA-seq的B细胞受体（BCR）组装，来自单细胞的编码RNA的RNA-seq EFO EFO_0005684 智人 B细胞受体（BCR）使单个B细胞能够识别多种抗原，包括细菌和病毒蛋白。尽管RNA-seq的进展已经
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络，提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
