基于检测和监测艰难梭菌感染患者的抗菌药物管理项目（PACTA-ICD）
源站描述指出研究使用基于质谱的蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学技术，探究艰难梭菌二元毒素（CDT）对 HEp-2 细胞蛋白质组和磷酸化蛋白质组的影响
基本信息
资源简介
基于检测和监测艰难梭菌感染患者的抗菌药物管理项目（PACTA-ICD）
Table_5_The Binary Toxin of Clostridioides difficile Alters the Proteome and Phosphoproteome of HEp-2 Cells.docx
该数据集来自 frontiersin.figshare.com，包含一份名为 Table_5_The Binary Toxin of Clostridioides difficile Alters the Proteome and Phosphoproteome of HEp-2 Cells.docx 的文件，配套论文发表于 International Journal of Molecular Sciences。源站描述指出研究使用基于质谱的蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学技术，探究艰难梭菌二元毒素（CDT）对 HEp-2 细胞蛋白质组和磷酸化蛋白质组的影响。数据可用于了解 CDT 作用机制相关的蛋白质与磷酸化修饰变化（来源 figsh。
【数据集背景】
配套论文《The Importance of Therapeutically Targeting the Binary Toxin from Clostridioides difficile》发表于 International Journal of Molecular Sciences（2021），DOI：10.3390/ijms22062926。源站首次发布：2021-09-14。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：艰难梭菌（Clostridioides difficile）是全球医院内感染的主要原因，引起抗生素相关性腹泻，部分病例可导致假膜性结肠炎。主要毒力因子为毒素 A 和毒素 B。高毒力艰难梭菌菌株与较高死亡率相关，且大多数此类菌株还产生艰难梭菌二元毒素（CDT），该毒素具有两个亚基 CDTa 和 CDTb。后者负责结合并将 CDTa 转运至靶细胞质；CDTa 是一种 ADP 核糖基转移酶，催化肌动蛋白纤维的修饰，扰乱肌动蛋白与微管之间的平衡，并诱导细胞膜基于微管的突起，增加艰难梭菌的黏附。其潜在机制仍不明确。因此，我们使用基于质谱的蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学技术进行了筛选实验。上皮
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 15.33 KB。数据集 DOI：10.3389/fmicb.2021.725612.s009。
【主题与分类】
源站学科分类：Microbiology、Microbial Genetics、Microbial Ecology、Mycology。主题标签：binary toxin、Clostridioides difficile、proteome、phosphoproteome、signaling。本站分类：感染性疾病。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Microbiology、Microbial Genetics、Microbial Ecology、Mycology。
【获取与许可】
源站页面：https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table_5_The_Binary_Toxin_of_Clostridioides_difficile_Alters_the_Proteome_and_Phosphoproteome_of_HEp-2_Cells_docx/16617322
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Stieglitz, Florian; Gerhard, Ralf; Pich, Andreas (2021). Table_5_The Binary Toxin of Clostridioides difficile Alters the Proteome and Phosphoproteome of HEp-2 Cells.docx. Frontiers. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-09，引用时请注意版本时效。
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数据集获取（Figshare）
- 源站标题：Table_5_The Binary Toxin of Clostridioides difficile Alters the Proteome and Phosphoproteome of HEp-2 Cells.docx
- DOI：10.3389/fmicb.2021.725612.s009
- 发布日期：2021-09-14
- 文件数：1 个
- 文件总体积：15.33 KB
- 源站页面：https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table_5_The_Binary_Toxin_of_Clostridioides_difficile_Alters_the_Proteome_and_Phosphoproteome_of_HEp-2_Cells_docx/16617322
命令行下载
curl -L -o "Table_5_The Binary Toxin of Clostridioides difficile Alters the Proteome and Phosphoproteome of HEp-2 Cells.docx" "https://ndownloader.figshare.com/files/30758707"
文件清单
Table_5_The Binary Toxin of Clostridioides difficile Alters the Proteome and Phosphoproteome of HEp-2 Cells.docx（15.33 KB）
文件总体积 15.33 KB（源站 API 实测）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
艰难梭菌（Clostridioides difficile）是全球医院内感染的主要原因，可引起抗生素相关性腹泻，部分病例可导致假膜性结肠炎。其主要毒力因子为毒素A和毒素B。高毒力艰难梭菌菌株与较高的死亡率相关，且大多数此类菌株还产生艰难梭菌二元毒素（CDT），该毒素具有两个亚基，即CDTa和CDTb。后者负责结合并将CDTa转运至靶细胞质中；CDTa是一种ADP核糖基转移酶，催化肌动蛋白纤维的修饰，扰乱肌动蛋白与微管之间的平衡，并诱导细胞膜产生基于微管的突起，从而增强艰难梭菌的黏附。其潜在机制仍不明确。因此，我们采用基于质谱的蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学技术进行了筛选实验。在多重复研究中，用CDTa和CDTb处理上皮Hep-2细胞4小时和8小时。使用TiO2和Fe-NTA亲和色谱进行磷酸肽富集；定量采用基于TMT的方法和DDA测量。
在所有时间点共鉴定并定量了4,300多种蛋白质和5,600多个磷酸化位点。尽管在蛋白质组水平上仅观察到中等程度的变化，但近1,100个磷酸化位点的磷酸化水平对毒素处理产生了响应。数据表明，CSNK2A1可能作为CDT处理后的效应激酶发挥作用。此外，我们首次证实了肌动蛋白Arg-177位点上的ADP-核糖基化及其修饰动力学。
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.3389/fmicb.2021.725612.s009（source: https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table_5_The_Binary_Toxin_of_Clostridioides_difficile_Alters_the_Proteome_and_Phosphoproteome_of_HEp-2_Cells_docx/16617322）。
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