抗生素相互作用塑造粪肠球菌耐药性的短期进化

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3Adf4fb912c3e21ec6ef623e500fad78c8bc87a555b7194b57c1cb789cae88e853

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

抗生素联合用药正日益广泛地用于对抗细菌感染。多药疗法是应对粪肠球菌（E. faecalis）的一种尤为重要治疗选择，该机会性病原体可导致高接种量感染，如感染性心内膜炎。尽管已鉴定出众多针对粪肠球菌的协同药物组合，但关于不同组合如何影响耐药性进化速率的认识却少得多。在本研究中，我们采用高通量实验室进化实验，量化粪肠球菌在暴露于表现出不同相互作用类别（从协同到抑制）的药物组合时的生长速率适应和耐药性变化。我们观察到广泛的进化行为，包括生长适应速率的加快和减慢，这取决于药物相互作用与耐药性特征之间的具体相互作用。例如，在双β-内酰胺组合中的选择导致生长适应加速……

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。