异基因造血干细胞移植后移植物抗宿主病转录组谱分析

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT03136757

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件：移植物抗宿主病，造血干细胞。移植物抗宿主病（GVHD）是造血干细胞移植（HSC）后常见且严重的并发症，尽管近几十年来已开发出预防策略，它仍是导致显著早期死亡率的原因，尤其是当其对一线治疗耐药时。目前的诊断困难、缺乏特异性，需结合提示性临床背景（异基因造血干细胞移植、出现时间早于J100、特征性临床表现）、提示性解剖病理分析（以淋巴细胞为主的炎性浸润、黏膜水肿及凋亡小体存在）以及排除任何鉴别诊断（特别是血清学/病毒PCR阴性）。然而，迄今为止对该表现尚无分子层面的特征描述，因此也无特异性治疗。nCounter® nanostring技术能够快速简便地分析一组基因（同一样本最多可达800个）的同时表达，所需RNA量极少，且适用于难以处理的样本，如已用甲醛固定并包埋于石蜡中的组织。

它能够检测所分析组织的“分子特征”。此前从未对患有GVHD的人体组织进行过转录组学分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。