ACHN-490注射液治疗复杂性尿路感染或急性肾盂肾炎的双盲随机对照研究

数据集获取（Figshare）

• 源站标题：DataSheet_1_Fluoroquinolone resistance in complicated urinary tract infections: association with the increased occurrence and diversity of Escherichia coli of clonal complex 131, together with ST1193.docx
• DOI：10.3389/fcimb.2024.1351618.s001
• 发布日期：2024-02-27
• 文件数：1 个
• 文件总体积：809.61 KB
• 源站页面：https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/DataSheet_1_Fluoroquinolone_resistance_in_complicated_urinary_tract_infections_association_with_the_increased_occurrence_and_diversity_of_Escherichia_coli_of_clonal_complex_131_together_with_ST1193_docx/25294243

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数据加载示例（图像类）

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import glob, os

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       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
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# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

引言尿路感染（UTI）是多重耐药（MDR）传播和感染相关死亡的主要原因之一。大肠埃希菌是迄今为止最主要的致病菌。我们开展了一项关于复杂性尿路感染（cUTI）的前瞻性研究，旨在：i）监测可能影响治疗管理的高风险克隆；ii）将cUTI的病原学与同期、同医疗区域内发生的非复杂性感染（uUTI）进行比较。方法研究收集了2020年西班牙阿斯图里亚斯中央大学医院（Hospital Universitario Central de Asturias）从cUTI中分离的154株非重复大肠埃希菌。结果大多数cUTI分离株属于B2系统发育群（72.1%），并符合尿路致病性大肠埃希菌（UPEC）特征（69.5%）（携带chuA、fyuA、vat和yfcV基因中≥3个）。35.7%的分离株表现为MDR，与uUTI收集中观察到的数据相似。cUTI中观察到的一个显著差异是氟喹诺酮耐药（FQR）水平较高（47.4%），其中大流行克隆群B2-CC131和B2-ST1193（CH14-64）占154株大肠埃希菌的28%，占FQR分离株的52.1%。

其他流行的FQR克隆为D-ST69（CH35-27）、D-ST405（CH37-27）和B2-ST429（CH40-20）（各三株分离株）。我们揭示了CC131更高的遗传和基因组多样性：10种不同的病毒型、8种克隆型（CH）和2种ST型。在12株（7.8%）分离株（均为CC131）中检测到blaCTX-M-15的存在，这些分离株显示出10种不同的核心基因组（cg）ST型和2种fimH型（fimH30和fimH602），但具有相同的赋予FQR的染色体突变集（gyrA p.S83L、gyrA p.D87N、parC p.S80I、parC p.E84V和parE p.I529L）。此外，质粒组分析揭示了CC131基因组中10种不同的IncF公式。结论我们在此证明，非乳糖发酵筛选，结合O25b（rfbO25b）、H4（fliCH4）和H5（fliCH5）基因的检测，以及系统发育群和克隆型分型指派，是一种合理的方法，可轻松实施用于监测与cUTIs中FQR传播相关的新兴高风险克隆，例如不常报道的O25b:H4-B2-ST9126-CC131（CH1267-30）。由于大肠杆菌CC131和ST1193也

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.3389/fcimb.2024.1351618.s001（source: https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/DataSheet_1_Fluoroquinolone_resistance_in_complicated_urinary_tract_infections_association_with_the_increased_occurrence_and_diversity_of_Escherichia_coli_of_clonal_complex_131_together_with_ST1193_docx/25294243）。