癌症基因组图谱-胃腺癌数据集
胃腺癌的发生与特定的病原微生物感染（如幽门螺杆菌、EB病毒）密切相关。TCGA-STAD 数据集专门对队列中患者的 EB 病毒感染亚型进行了详尽标注，结合其转录组和甲基化数据，可用于深入探究感染介导的肿瘤微环境改变。
基本信息
资源简介
癌症基因组图谱-胃腺癌数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Stomach Adenocarcinoma》。
【数据内容】
源站原始描述：disease_type: Adenomas and Adenocarcinomas, Cystic, Mucinous and Serous Neoplasms；primary_site: Stomach；data categories: Simple Nucleotide Variation, Sequencing Reads, Biospecimen, Clinical, Copy Number Variation, Transcriptome Profiling, DNA Methylation, Proteome Profiling, Somatic Structural Variation, Structural Variation；Stomach Adenocarcinoma；TCGA-STAD
【主题与分类】
主题标签：[''Adenomas and Adenocarcinomas'', ''Cystic, Mucinous and Serous Neoplasms'']、[''Stomach'']。
【适用方向】
多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。
【获取与许可】
源站页面：https://portal.gdc.cancer.gov/projects/TCGA-STAD
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
需登录公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://portal.gdc.cancer.gov/projects/TCGA-STAD
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 180.00 GB。
数据说明
该数据集包含胃癌患者的详细分子图谱与临床特征，其中包括EB病毒（Epstein-Barr Virus）感染状态评估，是研究EBV相关胃癌的重要公开资源。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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