癌症基因组图谱-肝细胞癌数据集
TCGA-LIHC 是癌症基因组图谱项目下针对肝细胞癌建立的权威多组学数据集。由于肝癌与肝炎病毒感染高度相关，该数据集中详细记录了患者的 HBV/HCV 感染情况，极为适合探索病毒感染驱动的肿瘤发生机制及预后特征。
基本信息
模态
多模态,表格
大小
200 GB
数据量
377
任务类型
生存分析,分类
许可
NIH Genomic Data Sharing Policy
创建/更新时间
2024-03-26
资源简介
该数据集涵盖肝细胞癌患者的临床和多组学特征，包含详细的乙型肝炎病毒（HBV）和丙型肝炎病毒（HCV）感染状态，是研究病毒感染与癌症发生发展关系的核心数据。
下载信息
注册下载
Tips: 该数据集需要在对应的数据源网站注册通过后，才能进行数据下载，注册有对应要求，或者需要收费。
需登录公开下载
Tips: 该数据集属于公开下载，应该可以免费公开下载。
暂未开放有偿下载
Tips: 该数据集 Qianfanghub 可以协助提供有偿下载服务，注意，服务不针对数据相关产权，只是技术服务费。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放千方医数集，医疗数据集部分，是为社区服务的公开医疗数据集搜索引擎，并不存储或者下载原始的任何数据。 如果您有其他医疗数据需求，可以和客服联系，或者下工单。我们有强大的三甲医疗机构帮助您提供个性化的医疗数据定制、采集、标注服务。
使用方式
数据集获取
源站：https://portal.gdc.cancer.gov/projects/TCGA-LIHC
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 200.00 GB。
数据说明
该数据集涵盖肝细胞癌患者的临床和多组学特征，包含详细的乙型肝炎病毒（HBV）和丙型肝炎病毒（HCV）感染状态，是研究病毒感染与癌症发生发展关系的核心数据。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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